Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
RUNDC1Q96C34 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
RUNDC1Q96C34 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
RUNDC1Q96C34 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
RUNDC1Q96C34 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
RUNDC1Q96C34 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
RUNDC1Q96C34 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
RUNDC1Q96C34 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
RUNDC1Q96C34 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
RUNDC1Q96C34 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
RUNDC1Q96C34 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
RUNDC1Q96C34 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
RUNDC1Q96C34 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
RUNDC1Q96C34 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
RUNDC1Q96C34 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC33.73■■■□□ 2.99
RUNDC1Q96C34 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
RUNDC1Q96C34 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
RUNDC1Q96C34 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
RUNDC1Q96C34 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
RUNDC1Q96C34 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
RUNDC1Q96C34 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
RUNDC1Q96C34 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
RUNDC1Q96C34 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
RUNDC1Q96C34 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC33.7■■■□□ 2.99
RUNDC1Q96C34 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
RUNDC1Q96C34 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
RUNDC1Q96C34 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
RUNDC1Q96C34 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
RUNDC1Q96C34 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
RUNDC1Q96C34 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
RUNDC1Q96C34 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
RUNDC1Q96C34 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
RUNDC1Q96C34 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
RUNDC1Q96C34 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
RUNDC1Q96C34 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
RUNDC1Q96C34 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
RUNDC1Q96C34 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
RUNDC1Q96C34 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
RUNDC1Q96C34 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
RUNDC1Q96C34 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
RUNDC1Q96C34 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
RUNDC1Q96C34 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
RUNDC1Q96C34 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
RUNDC1Q96C34 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
RUNDC1Q96C34 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
RUNDC1Q96C34 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
RUNDC1Q96C34 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
RUNDC1Q96C34 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
RUNDC1Q96C34 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
RUNDC1Q96C34 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
RUNDC1Q96C34 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
RUNDC1Q96C34 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC33.61■■■□□ 2.97
RUNDC1Q96C34 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
RUNDC1Q96C34 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
RUNDC1Q96C34 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
RUNDC1Q96C34 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
RUNDC1Q96C34 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
RUNDC1Q96C34 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
RUNDC1Q96C34 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
RUNDC1Q96C34 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
RUNDC1Q96C34 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
RUNDC1Q96C34 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC33.58■■■□□ 2.97
RUNDC1Q96C34 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
RUNDC1Q96C34 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
RUNDC1Q96C34 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
RUNDC1Q96C34 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
RUNDC1Q96C34 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
RUNDC1Q96C34 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
RUNDC1Q96C34 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
RUNDC1Q96C34 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
RUNDC1Q96C34 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
RUNDC1Q96C34 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
RUNDC1Q96C34 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
RUNDC1Q96C34 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
RUNDC1Q96C34 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
RUNDC1Q96C34 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
RUNDC1Q96C34 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
RUNDC1Q96C34 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
RUNDC1Q96C34 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
RUNDC1Q96C34 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
RUNDC1Q96C34 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
RUNDC1Q96C34 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
RUNDC1Q96C34 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
RUNDC1Q96C34 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
RUNDC1Q96C34 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
RUNDC1Q96C34 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
RUNDC1Q96C34 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
RUNDC1Q96C34 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
RUNDC1Q96C34 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
RUNDC1Q96C34 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
RUNDC1Q96C34 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
RUNDC1Q96C34 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
RUNDC1Q96C34 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
RUNDC1Q96C34 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
RUNDC1Q96C34 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
RUNDC1Q96C34 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
RUNDC1Q96C34 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
RUNDC1Q96C34 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
RUNDC1Q96C34 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
RUNDC1Q96C34 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.3 ms