Protein–RNA interactions for Protein: Q96B86

RGMA, Repulsive guidance molecule A, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMAQ96B86 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGMAQ96B86 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGMAQ96B86 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RGMAQ96B86 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RGMAQ96B86 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RGMAQ96B86 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGMAQ96B86 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGMAQ96B86 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGMAQ96B86 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGMAQ96B86 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGMAQ96B86 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGMAQ96B86 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGMAQ96B86 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RGMAQ96B86 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGMAQ96B86 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGMAQ96B86 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGMAQ96B86 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGMAQ96B86 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RGMAQ96B86 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RGMAQ96B86 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RGMAQ96B86 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RGMAQ96B86 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RGMAQ96B86 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RGMAQ96B86 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RGMAQ96B86 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RGMAQ96B86 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RGMAQ96B86 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGMAQ96B86 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGMAQ96B86 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGMAQ96B86 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGMAQ96B86 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGMAQ96B86 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGMAQ96B86 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RGMAQ96B86 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGMAQ96B86 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGMAQ96B86 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGMAQ96B86 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RGMAQ96B86 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RGMAQ96B86 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RGMAQ96B86 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RGMAQ96B86 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RGMAQ96B86 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RGMAQ96B86 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RGMAQ96B86 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RGMAQ96B86 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RGMAQ96B86 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RGMAQ96B86 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RGMAQ96B86 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RGMAQ96B86 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RGMAQ96B86 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RGMAQ96B86 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RGMAQ96B86 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RGMAQ96B86 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RGMAQ96B86 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RGMAQ96B86 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RGMAQ96B86 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RGMAQ96B86 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RGMAQ96B86 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RGMAQ96B86 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGMAQ96B86 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGMAQ96B86 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGMAQ96B86 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RGMAQ96B86 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGMAQ96B86 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGMAQ96B86 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RGMAQ96B86 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RGMAQ96B86 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RGMAQ96B86 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RGMAQ96B86 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RGMAQ96B86 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RGMAQ96B86 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
RGMAQ96B86 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGMAQ96B86 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGMAQ96B86 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RGMAQ96B86 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RGMAQ96B86 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RGMAQ96B86 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGMAQ96B86 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGMAQ96B86 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGMAQ96B86 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGMAQ96B86 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGMAQ96B86 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RGMAQ96B86 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RGMAQ96B86 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RGMAQ96B86 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RGMAQ96B86 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RGMAQ96B86 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RGMAQ96B86 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RGMAQ96B86 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RGMAQ96B86 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RGMAQ96B86 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGMAQ96B86 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGMAQ96B86 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGMAQ96B86 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RGMAQ96B86 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RGMAQ96B86 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RGMAQ96B86 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RGMAQ96B86 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RGMAQ96B86 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RGMAQ96B86 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms