Protein–RNA interactions for Protein: Q96AK3

APOBEC3D, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3DQ96AK3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBEC3DQ96AK3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBEC3DQ96AK3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBEC3DQ96AK3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBEC3DQ96AK3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBEC3DQ96AK3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBEC3DQ96AK3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBEC3DQ96AK3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOBEC3DQ96AK3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBEC3DQ96AK3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBEC3DQ96AK3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBEC3DQ96AK3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOBEC3DQ96AK3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOBEC3DQ96AK3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOBEC3DQ96AK3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOBEC3DQ96AK3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
APOBEC3DQ96AK3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOBEC3DQ96AK3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOBEC3DQ96AK3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOBEC3DQ96AK3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOBEC3DQ96AK3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOBEC3DQ96AK3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOBEC3DQ96AK3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
APOBEC3DQ96AK3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOBEC3DQ96AK3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOBEC3DQ96AK3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOBEC3DQ96AK3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOBEC3DQ96AK3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOBEC3DQ96AK3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOBEC3DQ96AK3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOBEC3DQ96AK3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOBEC3DQ96AK3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOBEC3DQ96AK3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOBEC3DQ96AK3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOBEC3DQ96AK3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOBEC3DQ96AK3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOBEC3DQ96AK3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOBEC3DQ96AK3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC3DQ96AK3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC3DQ96AK3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC3DQ96AK3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC3DQ96AK3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC3DQ96AK3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC3DQ96AK3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBEC3DQ96AK3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBEC3DQ96AK3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBEC3DQ96AK3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBEC3DQ96AK3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBEC3DQ96AK3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBEC3DQ96AK3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBEC3DQ96AK3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
APOBEC3DQ96AK3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
APOBEC3DQ96AK3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
APOBEC3DQ96AK3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
APOBEC3DQ96AK3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
APOBEC3DQ96AK3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
APOBEC3DQ96AK3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBEC3DQ96AK3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBEC3DQ96AK3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBEC3DQ96AK3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBEC3DQ96AK3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBEC3DQ96AK3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBEC3DQ96AK3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC3DQ96AK3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC3DQ96AK3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC3DQ96AK3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC3DQ96AK3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC3DQ96AK3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBEC3DQ96AK3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBEC3DQ96AK3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBEC3DQ96AK3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBEC3DQ96AK3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBEC3DQ96AK3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBEC3DQ96AK3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBEC3DQ96AK3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBEC3DQ96AK3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBEC3DQ96AK3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBEC3DQ96AK3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBEC3DQ96AK3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBEC3DQ96AK3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBEC3DQ96AK3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBEC3DQ96AK3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBEC3DQ96AK3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC3DQ96AK3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOBEC3DQ96AK3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOBEC3DQ96AK3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOBEC3DQ96AK3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOBEC3DQ96AK3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOBEC3DQ96AK3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOBEC3DQ96AK3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOBEC3DQ96AK3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOBEC3DQ96AK3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOBEC3DQ96AK3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOBEC3DQ96AK3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOBEC3DQ96AK3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
APOBEC3DQ96AK3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC3DQ96AK3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC3DQ96AK3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC3DQ96AK3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC3DQ96AK3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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