Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAVIN3Q969G5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAVIN3Q969G5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAVIN3Q969G5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAVIN3Q969G5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CAVIN3Q969G5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAVIN3Q969G5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAVIN3Q969G5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAVIN3Q969G5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CAVIN3Q969G5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAVIN3Q969G5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAVIN3Q969G5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAVIN3Q969G5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAVIN3Q969G5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAVIN3Q969G5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAVIN3Q969G5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAVIN3Q969G5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAVIN3Q969G5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAVIN3Q969G5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAVIN3Q969G5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAVIN3Q969G5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAVIN3Q969G5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAVIN3Q969G5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAVIN3Q969G5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAVIN3Q969G5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAVIN3Q969G5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAVIN3Q969G5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAVIN3Q969G5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAVIN3Q969G5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAVIN3Q969G5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAVIN3Q969G5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAVIN3Q969G5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAVIN3Q969G5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAVIN3Q969G5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAVIN3Q969G5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAVIN3Q969G5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAVIN3Q969G5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAVIN3Q969G5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAVIN3Q969G5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAVIN3Q969G5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAVIN3Q969G5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CAVIN3Q969G5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAVIN3Q969G5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAVIN3Q969G5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAVIN3Q969G5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAVIN3Q969G5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CAVIN3Q969G5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CAVIN3Q969G5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CAVIN3Q969G5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CAVIN3Q969G5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CAVIN3Q969G5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAVIN3Q969G5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAVIN3Q969G5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAVIN3Q969G5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAVIN3Q969G5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAVIN3Q969G5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAVIN3Q969G5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAVIN3Q969G5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAVIN3Q969G5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAVIN3Q969G5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAVIN3Q969G5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAVIN3Q969G5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAVIN3Q969G5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAVIN3Q969G5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CAVIN3Q969G5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAVIN3Q969G5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CAVIN3Q969G5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CAVIN3Q969G5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAVIN3Q969G5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CAVIN3Q969G5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CAVIN3Q969G5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CAVIN3Q969G5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CAVIN3Q969G5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CAVIN3Q969G5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CAVIN3Q969G5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CAVIN3Q969G5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CAVIN3Q969G5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CAVIN3Q969G5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CAVIN3Q969G5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CAVIN3Q969G5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CAVIN3Q969G5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CAVIN3Q969G5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CAVIN3Q969G5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CAVIN3Q969G5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CAVIN3Q969G5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CAVIN3Q969G5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CAVIN3Q969G5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CAVIN3Q969G5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAVIN3Q969G5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAVIN3Q969G5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAVIN3Q969G5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CAVIN3Q969G5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CAVIN3Q969G5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CAVIN3Q969G5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CAVIN3Q969G5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CAVIN3Q969G5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CAVIN3Q969G5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CAVIN3Q969G5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CAVIN3Q969G5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CAVIN3Q969G5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms