Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
NKD2Q969F2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
NKD2Q969F2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
NKD2Q969F2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
NKD2Q969F2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NKD2Q969F2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NKD2Q969F2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
NKD2Q969F2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NKD2Q969F2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NKD2Q969F2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NKD2Q969F2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NKD2Q969F2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NKD2Q969F2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NKD2Q969F2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NKD2Q969F2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NKD2Q969F2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NKD2Q969F2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NKD2Q969F2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NKD2Q969F2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NKD2Q969F2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NKD2Q969F2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NKD2Q969F2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NKD2Q969F2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
NKD2Q969F2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NKD2Q969F2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NKD2Q969F2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NKD2Q969F2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NKD2Q969F2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NKD2Q969F2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NKD2Q969F2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NKD2Q969F2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
NKD2Q969F2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NKD2Q969F2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NKD2Q969F2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NKD2Q969F2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NKD2Q969F2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NKD2Q969F2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NKD2Q969F2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NKD2Q969F2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NKD2Q969F2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NKD2Q969F2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NKD2Q969F2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NKD2Q969F2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NKD2Q969F2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NKD2Q969F2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NKD2Q969F2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NKD2Q969F2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NKD2Q969F2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NKD2Q969F2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
NKD2Q969F2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NKD2Q969F2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NKD2Q969F2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NKD2Q969F2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NKD2Q969F2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NKD2Q969F2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
NKD2Q969F2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NKD2Q969F2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NKD2Q969F2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NKD2Q969F2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NKD2Q969F2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NKD2Q969F2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NKD2Q969F2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NKD2Q969F2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NKD2Q969F2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NKD2Q969F2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NKD2Q969F2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NKD2Q969F2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NKD2Q969F2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NKD2Q969F2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NKD2Q969F2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NKD2Q969F2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NKD2Q969F2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NKD2Q969F2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NKD2Q969F2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NKD2Q969F2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NKD2Q969F2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NKD2Q969F2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NKD2Q969F2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NKD2Q969F2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NKD2Q969F2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NKD2Q969F2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NKD2Q969F2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NKD2Q969F2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NKD2Q969F2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NKD2Q969F2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NKD2Q969F2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NKD2Q969F2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NKD2Q969F2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NKD2Q969F2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NKD2Q969F2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NKD2Q969F2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NKD2Q969F2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NKD2Q969F2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NKD2Q969F2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NKD2Q969F2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NKD2Q969F2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NKD2Q969F2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
NKD2Q969F2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NKD2Q969F2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NKD2Q969F2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms