Protein–RNA interactions for Protein: Q93084

ATP2A3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A3Q93084 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP2A3Q93084 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP2A3Q93084 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATP2A3Q93084 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP2A3Q93084 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP2A3Q93084 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP2A3Q93084 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP2A3Q93084 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP2A3Q93084 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP2A3Q93084 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP2A3Q93084 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP2A3Q93084 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP2A3Q93084 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP2A3Q93084 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP2A3Q93084 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP2A3Q93084 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATP2A3Q93084 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
ATP2A3Q93084 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
ATP2A3Q93084 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATP2A3Q93084 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATP2A3Q93084 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATP2A3Q93084 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATP2A3Q93084 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP2A3Q93084 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP2A3Q93084 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP2A3Q93084 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP2A3Q93084 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP2A3Q93084 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP2A3Q93084 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP2A3Q93084 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP2A3Q93084 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATP2A3Q93084 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATP2A3Q93084 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATP2A3Q93084 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATP2A3Q93084 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATP2A3Q93084 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATP2A3Q93084 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATP2A3Q93084 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATP2A3Q93084 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP2A3Q93084 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP2A3Q93084 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP2A3Q93084 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP2A3Q93084 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP2A3Q93084 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP2A3Q93084 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATP2A3Q93084 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATP2A3Q93084 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATP2A3Q93084 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATP2A3Q93084 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP2A3Q93084 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATP2A3Q93084 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATP2A3Q93084 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATP2A3Q93084 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATP2A3Q93084 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATP2A3Q93084 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATP2A3Q93084 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATP2A3Q93084 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATP2A3Q93084 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATP2A3Q93084 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP2A3Q93084 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP2A3Q93084 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP2A3Q93084 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP2A3Q93084 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP2A3Q93084 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATP2A3Q93084 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATP2A3Q93084 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP2A3Q93084 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP2A3Q93084 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP2A3Q93084 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP2A3Q93084 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP2A3Q93084 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP2A3Q93084 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP2A3Q93084 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATP2A3Q93084 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATP2A3Q93084 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATP2A3Q93084 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATP2A3Q93084 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP2A3Q93084 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP2A3Q93084 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP2A3Q93084 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATP2A3Q93084 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATP2A3Q93084 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATP2A3Q93084 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ATP2A3Q93084 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ATP2A3Q93084 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP2A3Q93084 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP2A3Q93084 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP2A3Q93084 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATP2A3Q93084 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATP2A3Q93084 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATP2A3Q93084 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATP2A3Q93084 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATP2A3Q93084 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATP2A3Q93084 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATP2A3Q93084 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATP2A3Q93084 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATP2A3Q93084 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ATP2A3Q93084 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATP2A3Q93084 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATP2A3Q93084 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms