Protein–RNA interactions for Protein: Q92982

NINJ1, Ninjurin-1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINJ1Q92982 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NINJ1Q92982 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NINJ1Q92982 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NINJ1Q92982 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NINJ1Q92982 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NINJ1Q92982 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NINJ1Q92982 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NINJ1Q92982 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NINJ1Q92982 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NINJ1Q92982 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NINJ1Q92982 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NINJ1Q92982 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NINJ1Q92982 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NINJ1Q92982 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NINJ1Q92982 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NINJ1Q92982 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NINJ1Q92982 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NINJ1Q92982 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NINJ1Q92982 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NINJ1Q92982 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NINJ1Q92982 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NINJ1Q92982 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NINJ1Q92982 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NINJ1Q92982 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NINJ1Q92982 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NINJ1Q92982 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NINJ1Q92982 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NINJ1Q92982 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NINJ1Q92982 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NINJ1Q92982 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NINJ1Q92982 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NINJ1Q92982 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NINJ1Q92982 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NINJ1Q92982 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NINJ1Q92982 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NINJ1Q92982 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NINJ1Q92982 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NINJ1Q92982 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NINJ1Q92982 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NINJ1Q92982 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NINJ1Q92982 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NINJ1Q92982 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NINJ1Q92982 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NINJ1Q92982 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NINJ1Q92982 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NINJ1Q92982 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NINJ1Q92982 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NINJ1Q92982 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NINJ1Q92982 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NINJ1Q92982 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NINJ1Q92982 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NINJ1Q92982 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NINJ1Q92982 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NINJ1Q92982 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NINJ1Q92982 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NINJ1Q92982 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NINJ1Q92982 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NINJ1Q92982 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NINJ1Q92982 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NINJ1Q92982 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NINJ1Q92982 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NINJ1Q92982 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NINJ1Q92982 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NINJ1Q92982 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NINJ1Q92982 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NINJ1Q92982 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NINJ1Q92982 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NINJ1Q92982 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NINJ1Q92982 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NINJ1Q92982 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NINJ1Q92982 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NINJ1Q92982 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NINJ1Q92982 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NINJ1Q92982 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NINJ1Q92982 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NINJ1Q92982 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NINJ1Q92982 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NINJ1Q92982 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NINJ1Q92982 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NINJ1Q92982 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NINJ1Q92982 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NINJ1Q92982 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NINJ1Q92982 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NINJ1Q92982 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NINJ1Q92982 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NINJ1Q92982 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NINJ1Q92982 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NINJ1Q92982 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NINJ1Q92982 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NINJ1Q92982 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NINJ1Q92982 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NINJ1Q92982 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NINJ1Q92982 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NINJ1Q92982 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NINJ1Q92982 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NINJ1Q92982 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NINJ1Q92982 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NINJ1Q92982 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NINJ1Q92982 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NINJ1Q92982 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms