Protein–RNA interactions for Protein: Q92922

SMARCC1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCC1Q92922 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
SMARCC1Q92922 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
SMARCC1Q92922 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
SMARCC1Q92922 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
SMARCC1Q92922 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
SMARCC1Q92922 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
SMARCC1Q92922 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
SMARCC1Q92922 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
SMARCC1Q92922 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
SMARCC1Q92922 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
SMARCC1Q92922 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
SMARCC1Q92922 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
SMARCC1Q92922 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
SMARCC1Q92922 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
SMARCC1Q92922 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
SMARCC1Q92922 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
SMARCC1Q92922 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
SMARCC1Q92922 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
SMARCC1Q92922 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
SMARCC1Q92922 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
SMARCC1Q92922 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
SMARCC1Q92922 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
SMARCC1Q92922 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SMARCC1Q92922 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
SMARCC1Q92922 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SMARCC1Q92922 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SMARCC1Q92922 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SMARCC1Q92922 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SMARCC1Q92922 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SMARCC1Q92922 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
SMARCC1Q92922 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
SMARCC1Q92922 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
SMARCC1Q92922 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
SMARCC1Q92922 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
SMARCC1Q92922 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
SMARCC1Q92922 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
SMARCC1Q92922 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
SMARCC1Q92922 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
SMARCC1Q92922 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
SMARCC1Q92922 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
SMARCC1Q92922 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SMARCC1Q92922 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SMARCC1Q92922 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
SMARCC1Q92922 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
SMARCC1Q92922 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
SMARCC1Q92922 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
SMARCC1Q92922 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
SMARCC1Q92922 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
SMARCC1Q92922 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
SMARCC1Q92922 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
SMARCC1Q92922 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
SMARCC1Q92922 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
SMARCC1Q92922 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC32.99■■■□□ 2.87
SMARCC1Q92922 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SMARCC1Q92922 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC32.98■■■□□ 2.87
SMARCC1Q92922 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
SMARCC1Q92922 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
SMARCC1Q92922 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
SMARCC1Q92922 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
SMARCC1Q92922 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
SMARCC1Q92922 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
SMARCC1Q92922 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
SMARCC1Q92922 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
SMARCC1Q92922 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
SMARCC1Q92922 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
SMARCC1Q92922 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
SMARCC1Q92922 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SMARCC1Q92922 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
SMARCC1Q92922 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
SMARCC1Q92922 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
SMARCC1Q92922 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
SMARCC1Q92922 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SMARCC1Q92922 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.92■■■□□ 2.86
SMARCC1Q92922 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SMARCC1Q92922 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
SMARCC1Q92922 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
SMARCC1Q92922 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
SMARCC1Q92922 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
SMARCC1Q92922 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
SMARCC1Q92922 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
SMARCC1Q92922 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
SMARCC1Q92922 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
SMARCC1Q92922 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
SMARCC1Q92922 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
SMARCC1Q92922 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
SMARCC1Q92922 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
SMARCC1Q92922 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
SMARCC1Q92922 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
SMARCC1Q92922 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
SMARCC1Q92922 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
SMARCC1Q92922 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
SMARCC1Q92922 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
SMARCC1Q92922 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
SMARCC1Q92922 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
SMARCC1Q92922 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
SMARCC1Q92922 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
SMARCC1Q92922 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
SMARCC1Q92922 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
SMARCC1Q92922 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
SMARCC1Q92922 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms