Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
EDAQ92838 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
EDAQ92838 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EDAQ92838 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EDAQ92838 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
EDAQ92838 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EDAQ92838 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EDAQ92838 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
EDAQ92838 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
EDAQ92838 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
EDAQ92838 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
EDAQ92838 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
EDAQ92838 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
EDAQ92838 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
EDAQ92838 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
EDAQ92838 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
EDAQ92838 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
EDAQ92838 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
EDAQ92838 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EDAQ92838 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
EDAQ92838 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EDAQ92838 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EDAQ92838 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
EDAQ92838 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
EDAQ92838 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EDAQ92838 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
EDAQ92838 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EDAQ92838 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EDAQ92838 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
EDAQ92838 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EDAQ92838 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EDAQ92838 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EDAQ92838 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EDAQ92838 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EDAQ92838 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EDAQ92838 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EDAQ92838 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
EDAQ92838 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EDAQ92838 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EDAQ92838 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
EDAQ92838 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EDAQ92838 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EDAQ92838 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EDAQ92838 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EDAQ92838 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
EDAQ92838 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EDAQ92838 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EDAQ92838 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EDAQ92838 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
EDAQ92838 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
EDAQ92838 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
EDAQ92838 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
EDAQ92838 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EDAQ92838 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EDAQ92838 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
EDAQ92838 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EDAQ92838 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EDAQ92838 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EDAQ92838 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
EDAQ92838 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EDAQ92838 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EDAQ92838 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EDAQ92838 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
EDAQ92838 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
EDAQ92838 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EDAQ92838 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
EDAQ92838 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
EDAQ92838 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EDAQ92838 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EDAQ92838 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
EDAQ92838 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
EDAQ92838 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
EDAQ92838 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
EDAQ92838 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
EDAQ92838 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EDAQ92838 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
EDAQ92838 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
EDAQ92838 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EDAQ92838 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EDAQ92838 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
EDAQ92838 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EDAQ92838 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
EDAQ92838 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EDAQ92838 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
EDAQ92838 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
EDAQ92838 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EDAQ92838 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EDAQ92838 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EDAQ92838 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EDAQ92838 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EDAQ92838 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EDAQ92838 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EDAQ92838 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EDAQ92838 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EDAQ92838 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
EDAQ92838 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EDAQ92838 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EDAQ92838 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EDAQ92838 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EDAQ92838 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms