Protein–RNA interactions for Protein: Q92832

NELL1, Protein kinase C-binding protein NELL1, humanhuman

Predictions only

Length 810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELL1Q92832 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NELL1Q92832 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NELL1Q92832 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NELL1Q92832 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NELL1Q92832 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NELL1Q92832 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NELL1Q92832 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NELL1Q92832 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NELL1Q92832 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NELL1Q92832 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NELL1Q92832 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NELL1Q92832 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NELL1Q92832 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
NELL1Q92832 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NELL1Q92832 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NELL1Q92832 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NELL1Q92832 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NELL1Q92832 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NELL1Q92832 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NELL1Q92832 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NELL1Q92832 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NELL1Q92832 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NELL1Q92832 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NELL1Q92832 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NELL1Q92832 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
NELL1Q92832 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NELL1Q92832 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NELL1Q92832 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NELL1Q92832 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NELL1Q92832 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NELL1Q92832 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NELL1Q92832 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NELL1Q92832 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NELL1Q92832 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NELL1Q92832 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NELL1Q92832 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NELL1Q92832 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NELL1Q92832 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NELL1Q92832 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NELL1Q92832 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NELL1Q92832 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NELL1Q92832 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NELL1Q92832 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NELL1Q92832 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NELL1Q92832 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NELL1Q92832 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NELL1Q92832 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NELL1Q92832 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NELL1Q92832 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NELL1Q92832 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NELL1Q92832 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
NELL1Q92832 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NELL1Q92832 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NELL1Q92832 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NELL1Q92832 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
NELL1Q92832 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NELL1Q92832 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NELL1Q92832 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NELL1Q92832 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NELL1Q92832 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
NELL1Q92832 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NELL1Q92832 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NELL1Q92832 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NELL1Q92832 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NELL1Q92832 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NELL1Q92832 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NELL1Q92832 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NELL1Q92832 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NELL1Q92832 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NELL1Q92832 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NELL1Q92832 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NELL1Q92832 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NELL1Q92832 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NELL1Q92832 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NELL1Q92832 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NELL1Q92832 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NELL1Q92832 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NELL1Q92832 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NELL1Q92832 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NELL1Q92832 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NELL1Q92832 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NELL1Q92832 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NELL1Q92832 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NELL1Q92832 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NELL1Q92832 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NELL1Q92832 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NELL1Q92832 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NELL1Q92832 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NELL1Q92832 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NELL1Q92832 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NELL1Q92832 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NELL1Q92832 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NELL1Q92832 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NELL1Q92832 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NELL1Q92832 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NELL1Q92832 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NELL1Q92832 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NELL1Q92832 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NELL1Q92832 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NELL1Q92832 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms