Protein–RNA interactions for Protein: Q92784

DPF3, Zinc finger protein DPF3, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPF3Q92784 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
DPF3Q92784 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DPF3Q92784 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DPF3Q92784 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DPF3Q92784 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DPF3Q92784 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DPF3Q92784 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DPF3Q92784 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DPF3Q92784 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DPF3Q92784 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
DPF3Q92784 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DPF3Q92784 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
DPF3Q92784 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
DPF3Q92784 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
DPF3Q92784 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
DPF3Q92784 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
DPF3Q92784 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
DPF3Q92784 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
DPF3Q92784 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
DPF3Q92784 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
DPF3Q92784 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
DPF3Q92784 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
DPF3Q92784 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
DPF3Q92784 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
DPF3Q92784 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
DPF3Q92784 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
DPF3Q92784 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
DPF3Q92784 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DPF3Q92784 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DPF3Q92784 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DPF3Q92784 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
DPF3Q92784 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
DPF3Q92784 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
DPF3Q92784 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
DPF3Q92784 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
DPF3Q92784 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
DPF3Q92784 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
DPF3Q92784 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
DPF3Q92784 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
DPF3Q92784 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
DPF3Q92784 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
DPF3Q92784 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
DPF3Q92784 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
DPF3Q92784 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
DPF3Q92784 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
DPF3Q92784 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
DPF3Q92784 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
DPF3Q92784 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
DPF3Q92784 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
DPF3Q92784 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
DPF3Q92784 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
DPF3Q92784 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
DPF3Q92784 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
DPF3Q92784 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
DPF3Q92784 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
DPF3Q92784 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
DPF3Q92784 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
DPF3Q92784 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
DPF3Q92784 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
DPF3Q92784 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
DPF3Q92784 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
DPF3Q92784 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
DPF3Q92784 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
DPF3Q92784 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
DPF3Q92784 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
DPF3Q92784 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
DPF3Q92784 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
DPF3Q92784 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DPF3Q92784 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DPF3Q92784 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
DPF3Q92784 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DPF3Q92784 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DPF3Q92784 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DPF3Q92784 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DPF3Q92784 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
DPF3Q92784 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DPF3Q92784 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DPF3Q92784 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DPF3Q92784 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
DPF3Q92784 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
DPF3Q92784 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
DPF3Q92784 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
DPF3Q92784 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
DPF3Q92784 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
DPF3Q92784 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
DPF3Q92784 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
DPF3Q92784 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
DPF3Q92784 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
DPF3Q92784 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
DPF3Q92784 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
DPF3Q92784 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
DPF3Q92784 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DPF3Q92784 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
DPF3Q92784 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DPF3Q92784 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DPF3Q92784 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DPF3Q92784 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DPF3Q92784 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
DPF3Q92784 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DPF3Q92784 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms