Protein–RNA interactions for Protein: Q92738

USP6NL, USP6 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6NLQ92738 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
USP6NLQ92738 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
USP6NLQ92738 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
USP6NLQ92738 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
USP6NLQ92738 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
USP6NLQ92738 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
USP6NLQ92738 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
USP6NLQ92738 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
USP6NLQ92738 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
USP6NLQ92738 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
USP6NLQ92738 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
USP6NLQ92738 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP6NLQ92738 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP6NLQ92738 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
USP6NLQ92738 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP6NLQ92738 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP6NLQ92738 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP6NLQ92738 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP6NLQ92738 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP6NLQ92738 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP6NLQ92738 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP6NLQ92738 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP6NLQ92738 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP6NLQ92738 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
USP6NLQ92738 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
USP6NLQ92738 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
USP6NLQ92738 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
USP6NLQ92738 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP6NLQ92738 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP6NLQ92738 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP6NLQ92738 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP6NLQ92738 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP6NLQ92738 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP6NLQ92738 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP6NLQ92738 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP6NLQ92738 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP6NLQ92738 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP6NLQ92738 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP6NLQ92738 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP6NLQ92738 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP6NLQ92738 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP6NLQ92738 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP6NLQ92738 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP6NLQ92738 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP6NLQ92738 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP6NLQ92738 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP6NLQ92738 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP6NLQ92738 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP6NLQ92738 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP6NLQ92738 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP6NLQ92738 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP6NLQ92738 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
USP6NLQ92738 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
USP6NLQ92738 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP6NLQ92738 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP6NLQ92738 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
USP6NLQ92738 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
USP6NLQ92738 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP6NLQ92738 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP6NLQ92738 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP6NLQ92738 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
USP6NLQ92738 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP6NLQ92738 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP6NLQ92738 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP6NLQ92738 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
USP6NLQ92738 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP6NLQ92738 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP6NLQ92738 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
USP6NLQ92738 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
USP6NLQ92738 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
USP6NLQ92738 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP6NLQ92738 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
USP6NLQ92738 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
USP6NLQ92738 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
USP6NLQ92738 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP6NLQ92738 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP6NLQ92738 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP6NLQ92738 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP6NLQ92738 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP6NLQ92738 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
USP6NLQ92738 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP6NLQ92738 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP6NLQ92738 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP6NLQ92738 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP6NLQ92738 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP6NLQ92738 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP6NLQ92738 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP6NLQ92738 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP6NLQ92738 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
USP6NLQ92738 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP6NLQ92738 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP6NLQ92738 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP6NLQ92738 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP6NLQ92738 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
USP6NLQ92738 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP6NLQ92738 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP6NLQ92738 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP6NLQ92738 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP6NLQ92738 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
USP6NLQ92738 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms