Protein–RNA interactions for Protein: Q92615

LARP4B, La-related protein 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP4BQ92615 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LARP4BQ92615 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LARP4BQ92615 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LARP4BQ92615 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LARP4BQ92615 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LARP4BQ92615 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LARP4BQ92615 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LARP4BQ92615 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LARP4BQ92615 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LARP4BQ92615 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LARP4BQ92615 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LARP4BQ92615 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LARP4BQ92615 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LARP4BQ92615 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LARP4BQ92615 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LARP4BQ92615 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LARP4BQ92615 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LARP4BQ92615 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LARP4BQ92615 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LARP4BQ92615 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LARP4BQ92615 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LARP4BQ92615 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LARP4BQ92615 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
LARP4BQ92615 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LARP4BQ92615 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LARP4BQ92615 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LARP4BQ92615 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LARP4BQ92615 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LARP4BQ92615 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LARP4BQ92615 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LARP4BQ92615 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LARP4BQ92615 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
LARP4BQ92615 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LARP4BQ92615 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LARP4BQ92615 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LARP4BQ92615 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LARP4BQ92615 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LARP4BQ92615 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LARP4BQ92615 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LARP4BQ92615 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
LARP4BQ92615 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
LARP4BQ92615 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
LARP4BQ92615 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LARP4BQ92615 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LARP4BQ92615 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LARP4BQ92615 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
LARP4BQ92615 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
LARP4BQ92615 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LARP4BQ92615 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LARP4BQ92615 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LARP4BQ92615 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LARP4BQ92615 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LARP4BQ92615 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LARP4BQ92615 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LARP4BQ92615 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LARP4BQ92615 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LARP4BQ92615 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LARP4BQ92615 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LARP4BQ92615 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LARP4BQ92615 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LARP4BQ92615 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
LARP4BQ92615 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LARP4BQ92615 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
LARP4BQ92615 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
LARP4BQ92615 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
LARP4BQ92615 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LARP4BQ92615 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LARP4BQ92615 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LARP4BQ92615 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LARP4BQ92615 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LARP4BQ92615 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
LARP4BQ92615 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LARP4BQ92615 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
LARP4BQ92615 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
LARP4BQ92615 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
LARP4BQ92615 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
LARP4BQ92615 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
LARP4BQ92615 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
LARP4BQ92615 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
LARP4BQ92615 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
LARP4BQ92615 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LARP4BQ92615 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LARP4BQ92615 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LARP4BQ92615 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LARP4BQ92615 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LARP4BQ92615 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LARP4BQ92615 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LARP4BQ92615 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LARP4BQ92615 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LARP4BQ92615 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LARP4BQ92615 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LARP4BQ92615 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LARP4BQ92615 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LARP4BQ92615 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LARP4BQ92615 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LARP4BQ92615 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LARP4BQ92615 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LARP4BQ92615 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LARP4BQ92615 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LARP4BQ92615 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms