Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCG3Q8WXD2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCG3Q8WXD2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCG3Q8WXD2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCG3Q8WXD2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCG3Q8WXD2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCG3Q8WXD2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCG3Q8WXD2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCG3Q8WXD2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCG3Q8WXD2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCG3Q8WXD2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCG3Q8WXD2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SCG3Q8WXD2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCG3Q8WXD2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCG3Q8WXD2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCG3Q8WXD2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCG3Q8WXD2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCG3Q8WXD2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SCG3Q8WXD2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCG3Q8WXD2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCG3Q8WXD2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCG3Q8WXD2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCG3Q8WXD2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCG3Q8WXD2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCG3Q8WXD2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCG3Q8WXD2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCG3Q8WXD2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCG3Q8WXD2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCG3Q8WXD2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCG3Q8WXD2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCG3Q8WXD2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCG3Q8WXD2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCG3Q8WXD2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCG3Q8WXD2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCG3Q8WXD2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCG3Q8WXD2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCG3Q8WXD2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCG3Q8WXD2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCG3Q8WXD2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCG3Q8WXD2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SCG3Q8WXD2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCG3Q8WXD2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCG3Q8WXD2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCG3Q8WXD2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCG3Q8WXD2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCG3Q8WXD2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCG3Q8WXD2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SCG3Q8WXD2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCG3Q8WXD2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCG3Q8WXD2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCG3Q8WXD2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCG3Q8WXD2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCG3Q8WXD2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCG3Q8WXD2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SCG3Q8WXD2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCG3Q8WXD2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCG3Q8WXD2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCG3Q8WXD2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCG3Q8WXD2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCG3Q8WXD2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCG3Q8WXD2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCG3Q8WXD2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCG3Q8WXD2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCG3Q8WXD2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SCG3Q8WXD2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SCG3Q8WXD2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SCG3Q8WXD2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SCG3Q8WXD2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SCG3Q8WXD2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SCG3Q8WXD2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SCG3Q8WXD2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SCG3Q8WXD2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SCG3Q8WXD2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCG3Q8WXD2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCG3Q8WXD2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCG3Q8WXD2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCG3Q8WXD2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCG3Q8WXD2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCG3Q8WXD2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCG3Q8WXD2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCG3Q8WXD2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCG3Q8WXD2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCG3Q8WXD2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCG3Q8WXD2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCG3Q8WXD2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCG3Q8WXD2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCG3Q8WXD2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCG3Q8WXD2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCG3Q8WXD2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCG3Q8WXD2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCG3Q8WXD2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCG3Q8WXD2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCG3Q8WXD2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCG3Q8WXD2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCG3Q8WXD2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCG3Q8WXD2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCG3Q8WXD2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCG3Q8WXD2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCG3Q8WXD2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCG3Q8WXD2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms