Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVN8

UBE2Q2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q2, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q2Q8WVN8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
UBE2Q2Q8WVN8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
UBE2Q2Q8WVN8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
UBE2Q2Q8WVN8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
UBE2Q2Q8WVN8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
UBE2Q2Q8WVN8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
UBE2Q2Q8WVN8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
UBE2Q2Q8WVN8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
UBE2Q2Q8WVN8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
UBE2Q2Q8WVN8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
UBE2Q2Q8WVN8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
UBE2Q2Q8WVN8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
UBE2Q2Q8WVN8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
UBE2Q2Q8WVN8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
UBE2Q2Q8WVN8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
UBE2Q2Q8WVN8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
UBE2Q2Q8WVN8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
UBE2Q2Q8WVN8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
UBE2Q2Q8WVN8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
UBE2Q2Q8WVN8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
UBE2Q2Q8WVN8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
UBE2Q2Q8WVN8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
UBE2Q2Q8WVN8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
UBE2Q2Q8WVN8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
UBE2Q2Q8WVN8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
UBE2Q2Q8WVN8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
UBE2Q2Q8WVN8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
UBE2Q2Q8WVN8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
UBE2Q2Q8WVN8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
UBE2Q2Q8WVN8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
UBE2Q2Q8WVN8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
UBE2Q2Q8WVN8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
UBE2Q2Q8WVN8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
UBE2Q2Q8WVN8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
UBE2Q2Q8WVN8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
UBE2Q2Q8WVN8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
UBE2Q2Q8WVN8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
UBE2Q2Q8WVN8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
UBE2Q2Q8WVN8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
UBE2Q2Q8WVN8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
UBE2Q2Q8WVN8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
UBE2Q2Q8WVN8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
UBE2Q2Q8WVN8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBE2Q2Q8WVN8 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
UBE2Q2Q8WVN8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBE2Q2Q8WVN8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBE2Q2Q8WVN8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBE2Q2Q8WVN8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.08
UBE2Q2Q8WVN8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
UBE2Q2Q8WVN8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
UBE2Q2Q8WVN8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
UBE2Q2Q8WVN8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
UBE2Q2Q8WVN8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
UBE2Q2Q8WVN8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
UBE2Q2Q8WVN8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
UBE2Q2Q8WVN8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
UBE2Q2Q8WVN8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
UBE2Q2Q8WVN8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
UBE2Q2Q8WVN8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
UBE2Q2Q8WVN8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
UBE2Q2Q8WVN8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
UBE2Q2Q8WVN8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
UBE2Q2Q8WVN8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
UBE2Q2Q8WVN8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
UBE2Q2Q8WVN8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
UBE2Q2Q8WVN8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
UBE2Q2Q8WVN8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
UBE2Q2Q8WVN8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
UBE2Q2Q8WVN8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
UBE2Q2Q8WVN8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
UBE2Q2Q8WVN8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
UBE2Q2Q8WVN8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
UBE2Q2Q8WVN8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
UBE2Q2Q8WVN8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
UBE2Q2Q8WVN8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
UBE2Q2Q8WVN8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
UBE2Q2Q8WVN8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
UBE2Q2Q8WVN8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
UBE2Q2Q8WVN8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
UBE2Q2Q8WVN8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
UBE2Q2Q8WVN8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
UBE2Q2Q8WVN8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
UBE2Q2Q8WVN8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
UBE2Q2Q8WVN8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
UBE2Q2Q8WVN8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
UBE2Q2Q8WVN8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
UBE2Q2Q8WVN8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
UBE2Q2Q8WVN8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
UBE2Q2Q8WVN8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
UBE2Q2Q8WVN8 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
UBE2Q2Q8WVN8 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
UBE2Q2Q8WVN8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
UBE2Q2Q8WVN8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
UBE2Q2Q8WVN8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
UBE2Q2Q8WVN8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
UBE2Q2Q8WVN8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
UBE2Q2Q8WVN8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
UBE2Q2Q8WVN8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
UBE2Q2Q8WVN8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
UBE2Q2Q8WVN8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms