Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC43.93■■■■■ 4.62
TRIM41Q8WV44 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC43.92■■■■■ 4.62
TRIM41Q8WV44 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
TRIM41Q8WV44 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
TRIM41Q8WV44 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
TRIM41Q8WV44 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
TRIM41Q8WV44 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
TRIM41Q8WV44 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
TRIM41Q8WV44 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC43.88■■■■■ 4.62
TRIM41Q8WV44 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.62
TRIM41Q8WV44 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC43.88■■■■■ 4.62
TRIM41Q8WV44 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
TRIM41Q8WV44 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC43.87■■■■■ 4.61
TRIM41Q8WV44 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.86■■■■■ 4.61
TRIM41Q8WV44 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC43.86■■■■■ 4.61
TRIM41Q8WV44 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
TRIM41Q8WV44 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC43.84■■■■■ 4.61
TRIM41Q8WV44 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.83■■■■■ 4.61
TRIM41Q8WV44 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC43.83■■■■■ 4.61
TRIM41Q8WV44 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
TRIM41Q8WV44 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC43.82■■■■■ 4.61
TRIM41Q8WV44 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC43.82■■■■■ 4.61
TRIM41Q8WV44 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC43.81■■■■■ 4.6
TRIM41Q8WV44 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.81■■■■■ 4.6
TRIM41Q8WV44 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.81■■■■■ 4.6
TRIM41Q8WV44 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC43.8■■■■■ 4.6
TRIM41Q8WV44 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.79■■■■■ 4.6
TRIM41Q8WV44 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC43.78■■■■■ 4.6
TRIM41Q8WV44 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC43.78■■■■■ 4.6
TRIM41Q8WV44 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.78■■■■■ 4.6
TRIM41Q8WV44 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.78■■■■■ 4.6
TRIM41Q8WV44 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.77■■■■■ 4.6
TRIM41Q8WV44 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.77■■■■■ 4.6
TRIM41Q8WV44 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC43.77■■■■■ 4.6
TRIM41Q8WV44 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC43.76■■■■■ 4.6
TRIM41Q8WV44 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC43.76■■■■■ 4.6
TRIM41Q8WV44 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
TRIM41Q8WV44 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.75■■■■■ 4.59
TRIM41Q8WV44 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.75■■■■■ 4.59
TRIM41Q8WV44 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC43.75■■■■■ 4.59
TRIM41Q8WV44 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC43.74■■■■■ 4.59
TRIM41Q8WV44 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC43.74■■■■■ 4.59
TRIM41Q8WV44 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
TRIM41Q8WV44 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC43.73■■■■■ 4.59
TRIM41Q8WV44 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC43.73■■■■■ 4.59
TRIM41Q8WV44 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC43.72■■■■■ 4.59
TRIM41Q8WV44 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.72■■■■■ 4.59
TRIM41Q8WV44 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC43.71■■■■■ 4.59
TRIM41Q8WV44 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC43.71■■■■■ 4.59
TRIM41Q8WV44 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC43.7■■■■■ 4.59
TRIM41Q8WV44 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.69■■■■■ 4.59
TRIM41Q8WV44 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
TRIM41Q8WV44 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.68■■■■■ 4.58
TRIM41Q8WV44 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
TRIM41Q8WV44 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC43.67■■■■■ 4.58
TRIM41Q8WV44 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
TRIM41Q8WV44 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.66■■■■■ 4.58
TRIM41Q8WV44 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.66■■■■■ 4.58
TRIM41Q8WV44 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.66■■■■■ 4.58
TRIM41Q8WV44 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.65■■■■■ 4.58
TRIM41Q8WV44 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC43.65■■■■■ 4.58
TRIM41Q8WV44 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC43.65■■■■■ 4.58
TRIM41Q8WV44 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC43.64■■■■■ 4.58
TRIM41Q8WV44 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.57
TRIM41Q8WV44 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC43.63■■■■■ 4.57
TRIM41Q8WV44 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.57
TRIM41Q8WV44 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
TRIM41Q8WV44 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC43.62■■■■■ 4.57
TRIM41Q8WV44 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.61■■■■■ 4.57
TRIM41Q8WV44 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC43.6■■■■■ 4.57
TRIM41Q8WV44 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC43.6■■■■■ 4.57
TRIM41Q8WV44 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC43.59■■■■■ 4.57
TRIM41Q8WV44 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
TRIM41Q8WV44 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC43.57■■■■■ 4.57
TRIM41Q8WV44 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.57
TRIM41Q8WV44 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC43.57■■■■■ 4.56
TRIM41Q8WV44 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.56■■■■■ 4.56
TRIM41Q8WV44 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.55■■■■■ 4.56
TRIM41Q8WV44 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC43.55■■■■■ 4.56
TRIM41Q8WV44 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.55■■■■■ 4.56
TRIM41Q8WV44 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
TRIM41Q8WV44 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
TRIM41Q8WV44 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
TRIM41Q8WV44 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
TRIM41Q8WV44 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
TRIM41Q8WV44 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
TRIM41Q8WV44 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC43.52■■■■■ 4.56
TRIM41Q8WV44 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC43.52■■■■■ 4.56
TRIM41Q8WV44 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC43.51■■■■■ 4.56
TRIM41Q8WV44 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC43.5■■■■■ 4.55
TRIM41Q8WV44 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC43.5■■■■■ 4.55
TRIM41Q8WV44 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC43.5■■■■■ 4.55
TRIM41Q8WV44 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC43.49■■■■■ 4.55
TRIM41Q8WV44 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC43.49■■■■■ 4.55
TRIM41Q8WV44 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.49■■■■■ 4.55
TRIM41Q8WV44 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC43.49■■■■■ 4.55
TRIM41Q8WV44 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC43.47■■■■■ 4.55
TRIM41Q8WV44 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC43.45■■■■■ 4.55
TRIM41Q8WV44 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
TRIM41Q8WV44 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC43.45■■■■■ 4.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms