Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUR7

C15orf40, UPF0235 protein C15orf40, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf40Q8WUR7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C15orf40Q8WUR7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C15orf40Q8WUR7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C15orf40Q8WUR7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C15orf40Q8WUR7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C15orf40Q8WUR7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C15orf40Q8WUR7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C15orf40Q8WUR7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C15orf40Q8WUR7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C15orf40Q8WUR7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C15orf40Q8WUR7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C15orf40Q8WUR7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C15orf40Q8WUR7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C15orf40Q8WUR7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C15orf40Q8WUR7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C15orf40Q8WUR7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C15orf40Q8WUR7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C15orf40Q8WUR7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C15orf40Q8WUR7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C15orf40Q8WUR7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C15orf40Q8WUR7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C15orf40Q8WUR7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C15orf40Q8WUR7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C15orf40Q8WUR7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C15orf40Q8WUR7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C15orf40Q8WUR7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
C15orf40Q8WUR7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C15orf40Q8WUR7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C15orf40Q8WUR7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C15orf40Q8WUR7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C15orf40Q8WUR7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
C15orf40Q8WUR7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C15orf40Q8WUR7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C15orf40Q8WUR7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C15orf40Q8WUR7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C15orf40Q8WUR7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C15orf40Q8WUR7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C15orf40Q8WUR7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C15orf40Q8WUR7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C15orf40Q8WUR7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C15orf40Q8WUR7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
C15orf40Q8WUR7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C15orf40Q8WUR7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C15orf40Q8WUR7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C15orf40Q8WUR7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C15orf40Q8WUR7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C15orf40Q8WUR7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C15orf40Q8WUR7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C15orf40Q8WUR7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C15orf40Q8WUR7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C15orf40Q8WUR7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C15orf40Q8WUR7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C15orf40Q8WUR7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C15orf40Q8WUR7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C15orf40Q8WUR7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
C15orf40Q8WUR7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
C15orf40Q8WUR7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
C15orf40Q8WUR7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C15orf40Q8WUR7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C15orf40Q8WUR7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C15orf40Q8WUR7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C15orf40Q8WUR7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C15orf40Q8WUR7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
C15orf40Q8WUR7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C15orf40Q8WUR7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C15orf40Q8WUR7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C15orf40Q8WUR7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
C15orf40Q8WUR7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C15orf40Q8WUR7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C15orf40Q8WUR7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C15orf40Q8WUR7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C15orf40Q8WUR7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C15orf40Q8WUR7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C15orf40Q8WUR7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C15orf40Q8WUR7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C15orf40Q8WUR7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C15orf40Q8WUR7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C15orf40Q8WUR7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C15orf40Q8WUR7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C15orf40Q8WUR7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C15orf40Q8WUR7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C15orf40Q8WUR7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C15orf40Q8WUR7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C15orf40Q8WUR7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C15orf40Q8WUR7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C15orf40Q8WUR7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C15orf40Q8WUR7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C15orf40Q8WUR7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C15orf40Q8WUR7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C15orf40Q8WUR7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C15orf40Q8WUR7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C15orf40Q8WUR7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C15orf40Q8WUR7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C15orf40Q8WUR7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
C15orf40Q8WUR7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C15orf40Q8WUR7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C15orf40Q8WUR7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C15orf40Q8WUR7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C15orf40Q8WUR7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C15orf40Q8WUR7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms