Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GIPC3Q8TF64 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GIPC3Q8TF64 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GIPC3Q8TF64 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GIPC3Q8TF64 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GIPC3Q8TF64 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GIPC3Q8TF64 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GIPC3Q8TF64 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
GIPC3Q8TF64 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.35
GIPC3Q8TF64 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GIPC3Q8TF64 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GIPC3Q8TF64 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GIPC3Q8TF64 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GIPC3Q8TF64 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GIPC3Q8TF64 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GIPC3Q8TF64 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GIPC3Q8TF64 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GIPC3Q8TF64 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GIPC3Q8TF64 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GIPC3Q8TF64 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GIPC3Q8TF64 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GIPC3Q8TF64 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GIPC3Q8TF64 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GIPC3Q8TF64 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GIPC3Q8TF64 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GIPC3Q8TF64 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GIPC3Q8TF64 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GIPC3Q8TF64 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GIPC3Q8TF64 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GIPC3Q8TF64 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GIPC3Q8TF64 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GIPC3Q8TF64 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GIPC3Q8TF64 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GIPC3Q8TF64 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GIPC3Q8TF64 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GIPC3Q8TF64 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GIPC3Q8TF64 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GIPC3Q8TF64 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GIPC3Q8TF64 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GIPC3Q8TF64 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GIPC3Q8TF64 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GIPC3Q8TF64 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GIPC3Q8TF64 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GIPC3Q8TF64 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GIPC3Q8TF64 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GIPC3Q8TF64 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GIPC3Q8TF64 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GIPC3Q8TF64 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GIPC3Q8TF64 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GIPC3Q8TF64 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GIPC3Q8TF64 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GIPC3Q8TF64 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GIPC3Q8TF64 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GIPC3Q8TF64 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GIPC3Q8TF64 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GIPC3Q8TF64 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GIPC3Q8TF64 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GIPC3Q8TF64 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GIPC3Q8TF64 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GIPC3Q8TF64 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GIPC3Q8TF64 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GIPC3Q8TF64 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GIPC3Q8TF64 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GIPC3Q8TF64 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GIPC3Q8TF64 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GIPC3Q8TF64 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GIPC3Q8TF64 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GIPC3Q8TF64 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GIPC3Q8TF64 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GIPC3Q8TF64 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GIPC3Q8TF64 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GIPC3Q8TF64 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GIPC3Q8TF64 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GIPC3Q8TF64 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GIPC3Q8TF64 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GIPC3Q8TF64 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GIPC3Q8TF64 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GIPC3Q8TF64 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GIPC3Q8TF64 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GIPC3Q8TF64 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GIPC3Q8TF64 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GIPC3Q8TF64 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GIPC3Q8TF64 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GIPC3Q8TF64 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GIPC3Q8TF64 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GIPC3Q8TF64 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GIPC3Q8TF64 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GIPC3Q8TF64 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GIPC3Q8TF64 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GIPC3Q8TF64 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GIPC3Q8TF64 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GIPC3Q8TF64 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GIPC3Q8TF64 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GIPC3Q8TF64 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GIPC3Q8TF64 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GIPC3Q8TF64 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GIPC3Q8TF64 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GIPC3Q8TF64 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GIPC3Q8TF64 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GIPC3Q8TF64 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms