Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEC5

SH3RF2, Putative E3 ubiquitin-protein ligase SH3RF2, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3RF2Q8TEC5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SH3RF2Q8TEC5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SH3RF2Q8TEC5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SH3RF2Q8TEC5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SH3RF2Q8TEC5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SH3RF2Q8TEC5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SH3RF2Q8TEC5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SH3RF2Q8TEC5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SH3RF2Q8TEC5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SH3RF2Q8TEC5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SH3RF2Q8TEC5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SH3RF2Q8TEC5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SH3RF2Q8TEC5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SH3RF2Q8TEC5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SH3RF2Q8TEC5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SH3RF2Q8TEC5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SH3RF2Q8TEC5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SH3RF2Q8TEC5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SH3RF2Q8TEC5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SH3RF2Q8TEC5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SH3RF2Q8TEC5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SH3RF2Q8TEC5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SH3RF2Q8TEC5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SH3RF2Q8TEC5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SH3RF2Q8TEC5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SH3RF2Q8TEC5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SH3RF2Q8TEC5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SH3RF2Q8TEC5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SH3RF2Q8TEC5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SH3RF2Q8TEC5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SH3RF2Q8TEC5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SH3RF2Q8TEC5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SH3RF2Q8TEC5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SH3RF2Q8TEC5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SH3RF2Q8TEC5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SH3RF2Q8TEC5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SH3RF2Q8TEC5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SH3RF2Q8TEC5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SH3RF2Q8TEC5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SH3RF2Q8TEC5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SH3RF2Q8TEC5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SH3RF2Q8TEC5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SH3RF2Q8TEC5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SH3RF2Q8TEC5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SH3RF2Q8TEC5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SH3RF2Q8TEC5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SH3RF2Q8TEC5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SH3RF2Q8TEC5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SH3RF2Q8TEC5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SH3RF2Q8TEC5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SH3RF2Q8TEC5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SH3RF2Q8TEC5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SH3RF2Q8TEC5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SH3RF2Q8TEC5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SH3RF2Q8TEC5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SH3RF2Q8TEC5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SH3RF2Q8TEC5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SH3RF2Q8TEC5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SH3RF2Q8TEC5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SH3RF2Q8TEC5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SH3RF2Q8TEC5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SH3RF2Q8TEC5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SH3RF2Q8TEC5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SH3RF2Q8TEC5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SH3RF2Q8TEC5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SH3RF2Q8TEC5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SH3RF2Q8TEC5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SH3RF2Q8TEC5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SH3RF2Q8TEC5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SH3RF2Q8TEC5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SH3RF2Q8TEC5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SH3RF2Q8TEC5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SH3RF2Q8TEC5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SH3RF2Q8TEC5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SH3RF2Q8TEC5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SH3RF2Q8TEC5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SH3RF2Q8TEC5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SH3RF2Q8TEC5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SH3RF2Q8TEC5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SH3RF2Q8TEC5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SH3RF2Q8TEC5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SH3RF2Q8TEC5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SH3RF2Q8TEC5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SH3RF2Q8TEC5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SH3RF2Q8TEC5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SH3RF2Q8TEC5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SH3RF2Q8TEC5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SH3RF2Q8TEC5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SH3RF2Q8TEC5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SH3RF2Q8TEC5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SH3RF2Q8TEC5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SH3RF2Q8TEC5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SH3RF2Q8TEC5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SH3RF2Q8TEC5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SH3RF2Q8TEC5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SH3RF2Q8TEC5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SH3RF2Q8TEC5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SH3RF2Q8TEC5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SH3RF2Q8TEC5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SH3RF2Q8TEC5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms