Protein–RNA interactions for Protein: Q8NI35

PATJ, InaD-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATJQ8NI35 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PATJQ8NI35 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PATJQ8NI35 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PATJQ8NI35 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PATJQ8NI35 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PATJQ8NI35 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PATJQ8NI35 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PATJQ8NI35 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PATJQ8NI35 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PATJQ8NI35 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PATJQ8NI35 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PATJQ8NI35 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PATJQ8NI35 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PATJQ8NI35 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PATJQ8NI35 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PATJQ8NI35 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PATJQ8NI35 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PATJQ8NI35 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PATJQ8NI35 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PATJQ8NI35 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PATJQ8NI35 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PATJQ8NI35 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PATJQ8NI35 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PATJQ8NI35 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PATJQ8NI35 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PATJQ8NI35 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PATJQ8NI35 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PATJQ8NI35 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PATJQ8NI35 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PATJQ8NI35 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PATJQ8NI35 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PATJQ8NI35 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PATJQ8NI35 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PATJQ8NI35 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PATJQ8NI35 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PATJQ8NI35 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PATJQ8NI35 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PATJQ8NI35 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PATJQ8NI35 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PATJQ8NI35 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PATJQ8NI35 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PATJQ8NI35 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PATJQ8NI35 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PATJQ8NI35 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PATJQ8NI35 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PATJQ8NI35 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PATJQ8NI35 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PATJQ8NI35 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PATJQ8NI35 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PATJQ8NI35 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PATJQ8NI35 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PATJQ8NI35 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PATJQ8NI35 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PATJQ8NI35 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PATJQ8NI35 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PATJQ8NI35 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PATJQ8NI35 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PATJQ8NI35 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PATJQ8NI35 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PATJQ8NI35 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PATJQ8NI35 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PATJQ8NI35 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PATJQ8NI35 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PATJQ8NI35 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PATJQ8NI35 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PATJQ8NI35 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PATJQ8NI35 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PATJQ8NI35 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PATJQ8NI35 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PATJQ8NI35 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PATJQ8NI35 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PATJQ8NI35 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PATJQ8NI35 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PATJQ8NI35 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PATJQ8NI35 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PATJQ8NI35 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PATJQ8NI35 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PATJQ8NI35 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PATJQ8NI35 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PATJQ8NI35 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PATJQ8NI35 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PATJQ8NI35 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PATJQ8NI35 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PATJQ8NI35 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PATJQ8NI35 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PATJQ8NI35 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PATJQ8NI35 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PATJQ8NI35 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PATJQ8NI35 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PATJQ8NI35 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PATJQ8NI35 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PATJQ8NI35 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PATJQ8NI35 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PATJQ8NI35 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PATJQ8NI35 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PATJQ8NI35 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PATJQ8NI35 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PATJQ8NI35 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PATJQ8NI35 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PATJQ8NI35 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms