Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHU2

CFAP61, Cilia- and flagella-associated protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 1,237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP61Q8NHU2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CFAP61Q8NHU2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CFAP61Q8NHU2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP61Q8NHU2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP61Q8NHU2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP61Q8NHU2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFAP61Q8NHU2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFAP61Q8NHU2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFAP61Q8NHU2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFAP61Q8NHU2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFAP61Q8NHU2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CFAP61Q8NHU2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CFAP61Q8NHU2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CFAP61Q8NHU2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CFAP61Q8NHU2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CFAP61Q8NHU2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CFAP61Q8NHU2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CFAP61Q8NHU2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CFAP61Q8NHU2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFAP61Q8NHU2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFAP61Q8NHU2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CFAP61Q8NHU2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFAP61Q8NHU2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFAP61Q8NHU2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFAP61Q8NHU2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFAP61Q8NHU2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFAP61Q8NHU2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFAP61Q8NHU2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFAP61Q8NHU2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFAP61Q8NHU2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFAP61Q8NHU2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFAP61Q8NHU2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP61Q8NHU2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP61Q8NHU2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP61Q8NHU2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP61Q8NHU2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP61Q8NHU2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP61Q8NHU2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP61Q8NHU2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP61Q8NHU2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP61Q8NHU2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP61Q8NHU2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP61Q8NHU2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP61Q8NHU2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP61Q8NHU2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP61Q8NHU2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP61Q8NHU2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP61Q8NHU2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP61Q8NHU2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP61Q8NHU2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP61Q8NHU2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP61Q8NHU2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP61Q8NHU2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP61Q8NHU2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP61Q8NHU2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP61Q8NHU2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP61Q8NHU2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP61Q8NHU2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP61Q8NHU2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP61Q8NHU2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP61Q8NHU2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP61Q8NHU2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP61Q8NHU2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP61Q8NHU2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP61Q8NHU2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP61Q8NHU2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP61Q8NHU2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP61Q8NHU2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP61Q8NHU2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP61Q8NHU2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP61Q8NHU2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP61Q8NHU2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP61Q8NHU2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP61Q8NHU2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP61Q8NHU2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP61Q8NHU2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP61Q8NHU2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP61Q8NHU2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP61Q8NHU2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP61Q8NHU2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP61Q8NHU2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP61Q8NHU2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CFAP61Q8NHU2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CFAP61Q8NHU2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CFAP61Q8NHU2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CFAP61Q8NHU2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CFAP61Q8NHU2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CFAP61Q8NHU2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFAP61Q8NHU2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFAP61Q8NHU2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CFAP61Q8NHU2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFAP61Q8NHU2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFAP61Q8NHU2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFAP61Q8NHU2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFAP61Q8NHU2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFAP61Q8NHU2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFAP61Q8NHU2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFAP61Q8NHU2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFAP61Q8NHU2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFAP61Q8NHU2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms