Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR7

CCDC148, Coiled-coil domain-containing protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC148Q8NFR7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC148Q8NFR7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC148Q8NFR7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC148Q8NFR7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC148Q8NFR7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC148Q8NFR7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC148Q8NFR7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC148Q8NFR7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC148Q8NFR7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC148Q8NFR7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC148Q8NFR7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC148Q8NFR7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC148Q8NFR7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC148Q8NFR7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC148Q8NFR7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC148Q8NFR7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC148Q8NFR7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC148Q8NFR7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC148Q8NFR7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC148Q8NFR7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC148Q8NFR7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CCDC148Q8NFR7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
CCDC148Q8NFR7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC148Q8NFR7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC148Q8NFR7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC148Q8NFR7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC148Q8NFR7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC148Q8NFR7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC148Q8NFR7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC148Q8NFR7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC148Q8NFR7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC148Q8NFR7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC148Q8NFR7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC148Q8NFR7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC148Q8NFR7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC148Q8NFR7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC148Q8NFR7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC148Q8NFR7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC148Q8NFR7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC148Q8NFR7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC148Q8NFR7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC148Q8NFR7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC148Q8NFR7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC148Q8NFR7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC148Q8NFR7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC148Q8NFR7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC148Q8NFR7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CCDC148Q8NFR7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC148Q8NFR7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC148Q8NFR7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC148Q8NFR7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC148Q8NFR7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC148Q8NFR7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC148Q8NFR7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC148Q8NFR7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC148Q8NFR7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC148Q8NFR7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC148Q8NFR7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC148Q8NFR7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC148Q8NFR7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC148Q8NFR7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC148Q8NFR7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC148Q8NFR7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC148Q8NFR7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC148Q8NFR7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC148Q8NFR7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC148Q8NFR7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC148Q8NFR7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC148Q8NFR7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC148Q8NFR7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC148Q8NFR7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC148Q8NFR7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC148Q8NFR7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC148Q8NFR7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC148Q8NFR7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC148Q8NFR7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC148Q8NFR7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CCDC148Q8NFR7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC148Q8NFR7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC148Q8NFR7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC148Q8NFR7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC148Q8NFR7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC148Q8NFR7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC148Q8NFR7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC148Q8NFR7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC148Q8NFR7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC148Q8NFR7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC148Q8NFR7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC148Q8NFR7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC148Q8NFR7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC148Q8NFR7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC148Q8NFR7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC148Q8NFR7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC148Q8NFR7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC148Q8NFR7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC148Q8NFR7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC148Q8NFR7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC148Q8NFR7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC148Q8NFR7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC148Q8NFR7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms