Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP9

ZNF555, Zinc finger protein 555, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF555Q8NEP9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF555Q8NEP9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF555Q8NEP9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF555Q8NEP9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF555Q8NEP9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF555Q8NEP9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF555Q8NEP9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF555Q8NEP9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF555Q8NEP9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF555Q8NEP9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF555Q8NEP9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF555Q8NEP9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF555Q8NEP9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF555Q8NEP9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNF555Q8NEP9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF555Q8NEP9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF555Q8NEP9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF555Q8NEP9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF555Q8NEP9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF555Q8NEP9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF555Q8NEP9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF555Q8NEP9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF555Q8NEP9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF555Q8NEP9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF555Q8NEP9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF555Q8NEP9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF555Q8NEP9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF555Q8NEP9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF555Q8NEP9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF555Q8NEP9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF555Q8NEP9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF555Q8NEP9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF555Q8NEP9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF555Q8NEP9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF555Q8NEP9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF555Q8NEP9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF555Q8NEP9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF555Q8NEP9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF555Q8NEP9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF555Q8NEP9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF555Q8NEP9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF555Q8NEP9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF555Q8NEP9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF555Q8NEP9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF555Q8NEP9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
ZNF555Q8NEP9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF555Q8NEP9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF555Q8NEP9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF555Q8NEP9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF555Q8NEP9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF555Q8NEP9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF555Q8NEP9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF555Q8NEP9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF555Q8NEP9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF555Q8NEP9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF555Q8NEP9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF555Q8NEP9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF555Q8NEP9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF555Q8NEP9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF555Q8NEP9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF555Q8NEP9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF555Q8NEP9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF555Q8NEP9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF555Q8NEP9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF555Q8NEP9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF555Q8NEP9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF555Q8NEP9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
ZNF555Q8NEP9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF555Q8NEP9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF555Q8NEP9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF555Q8NEP9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF555Q8NEP9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF555Q8NEP9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF555Q8NEP9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF555Q8NEP9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF555Q8NEP9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF555Q8NEP9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF555Q8NEP9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF555Q8NEP9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF555Q8NEP9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF555Q8NEP9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF555Q8NEP9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF555Q8NEP9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF555Q8NEP9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF555Q8NEP9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF555Q8NEP9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF555Q8NEP9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF555Q8NEP9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF555Q8NEP9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF555Q8NEP9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF555Q8NEP9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF555Q8NEP9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF555Q8NEP9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF555Q8NEP9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF555Q8NEP9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF555Q8NEP9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF555Q8NEP9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF555Q8NEP9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF555Q8NEP9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF555Q8NEP9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms