Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEG4

FAM83F, Protein FAM83F, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM83FQ8NEG4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM83FQ8NEG4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM83FQ8NEG4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM83FQ8NEG4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM83FQ8NEG4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM83FQ8NEG4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM83FQ8NEG4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM83FQ8NEG4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM83FQ8NEG4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM83FQ8NEG4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM83FQ8NEG4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM83FQ8NEG4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM83FQ8NEG4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM83FQ8NEG4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM83FQ8NEG4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM83FQ8NEG4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM83FQ8NEG4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM83FQ8NEG4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM83FQ8NEG4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM83FQ8NEG4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM83FQ8NEG4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM83FQ8NEG4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM83FQ8NEG4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
FAM83FQ8NEG4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM83FQ8NEG4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM83FQ8NEG4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM83FQ8NEG4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM83FQ8NEG4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM83FQ8NEG4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM83FQ8NEG4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM83FQ8NEG4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM83FQ8NEG4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM83FQ8NEG4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM83FQ8NEG4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM83FQ8NEG4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM83FQ8NEG4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM83FQ8NEG4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM83FQ8NEG4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM83FQ8NEG4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM83FQ8NEG4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM83FQ8NEG4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM83FQ8NEG4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM83FQ8NEG4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM83FQ8NEG4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM83FQ8NEG4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM83FQ8NEG4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM83FQ8NEG4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM83FQ8NEG4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM83FQ8NEG4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM83FQ8NEG4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM83FQ8NEG4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM83FQ8NEG4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM83FQ8NEG4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM83FQ8NEG4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM83FQ8NEG4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FAM83FQ8NEG4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FAM83FQ8NEG4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FAM83FQ8NEG4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FAM83FQ8NEG4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM83FQ8NEG4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM83FQ8NEG4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM83FQ8NEG4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM83FQ8NEG4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM83FQ8NEG4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM83FQ8NEG4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM83FQ8NEG4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM83FQ8NEG4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM83FQ8NEG4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM83FQ8NEG4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM83FQ8NEG4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM83FQ8NEG4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM83FQ8NEG4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM83FQ8NEG4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM83FQ8NEG4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM83FQ8NEG4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM83FQ8NEG4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM83FQ8NEG4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM83FQ8NEG4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM83FQ8NEG4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM83FQ8NEG4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM83FQ8NEG4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM83FQ8NEG4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM83FQ8NEG4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM83FQ8NEG4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM83FQ8NEG4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM83FQ8NEG4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM83FQ8NEG4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM83FQ8NEG4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM83FQ8NEG4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM83FQ8NEG4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM83FQ8NEG4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM83FQ8NEG4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM83FQ8NEG4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM83FQ8NEG4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM83FQ8NEG4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM83FQ8NEG4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM83FQ8NEG4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM83FQ8NEG4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM83FQ8NEG4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM83FQ8NEG4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms