Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE28

STKLD1, Serine/threonine kinase-like domain-containing protein STKLD1, humanhuman

Predictions only

Length 680 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STKLD1Q8NE28 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
STKLD1Q8NE28 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
STKLD1Q8NE28 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
STKLD1Q8NE28 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
STKLD1Q8NE28 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
STKLD1Q8NE28 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
STKLD1Q8NE28 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
STKLD1Q8NE28 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
STKLD1Q8NE28 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
STKLD1Q8NE28 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
STKLD1Q8NE28 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
STKLD1Q8NE28 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
STKLD1Q8NE28 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
STKLD1Q8NE28 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
STKLD1Q8NE28 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
STKLD1Q8NE28 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
STKLD1Q8NE28 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
STKLD1Q8NE28 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
STKLD1Q8NE28 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
STKLD1Q8NE28 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
STKLD1Q8NE28 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
STKLD1Q8NE28 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
STKLD1Q8NE28 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
STKLD1Q8NE28 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
STKLD1Q8NE28 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
STKLD1Q8NE28 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
STKLD1Q8NE28 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
STKLD1Q8NE28 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
STKLD1Q8NE28 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
STKLD1Q8NE28 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
STKLD1Q8NE28 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
STKLD1Q8NE28 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
STKLD1Q8NE28 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
STKLD1Q8NE28 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
STKLD1Q8NE28 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
STKLD1Q8NE28 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
STKLD1Q8NE28 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
STKLD1Q8NE28 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
STKLD1Q8NE28 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
STKLD1Q8NE28 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
STKLD1Q8NE28 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
STKLD1Q8NE28 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
STKLD1Q8NE28 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
STKLD1Q8NE28 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
STKLD1Q8NE28 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
STKLD1Q8NE28 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
STKLD1Q8NE28 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
STKLD1Q8NE28 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
STKLD1Q8NE28 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
STKLD1Q8NE28 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
STKLD1Q8NE28 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
STKLD1Q8NE28 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
STKLD1Q8NE28 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
STKLD1Q8NE28 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
STKLD1Q8NE28 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
STKLD1Q8NE28 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
STKLD1Q8NE28 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
STKLD1Q8NE28 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
STKLD1Q8NE28 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
STKLD1Q8NE28 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
STKLD1Q8NE28 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
STKLD1Q8NE28 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
STKLD1Q8NE28 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
STKLD1Q8NE28 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
STKLD1Q8NE28 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
STKLD1Q8NE28 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
STKLD1Q8NE28 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
STKLD1Q8NE28 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
STKLD1Q8NE28 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
STKLD1Q8NE28 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
STKLD1Q8NE28 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
STKLD1Q8NE28 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
STKLD1Q8NE28 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
STKLD1Q8NE28 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
STKLD1Q8NE28 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
STKLD1Q8NE28 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
STKLD1Q8NE28 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
STKLD1Q8NE28 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
STKLD1Q8NE28 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
STKLD1Q8NE28 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
STKLD1Q8NE28 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
STKLD1Q8NE28 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
STKLD1Q8NE28 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
STKLD1Q8NE28 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
STKLD1Q8NE28 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
STKLD1Q8NE28 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
STKLD1Q8NE28 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
STKLD1Q8NE28 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
STKLD1Q8NE28 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
STKLD1Q8NE28 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
STKLD1Q8NE28 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
STKLD1Q8NE28 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
STKLD1Q8NE28 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
STKLD1Q8NE28 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
STKLD1Q8NE28 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
STKLD1Q8NE28 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
STKLD1Q8NE28 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
STKLD1Q8NE28 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
STKLD1Q8NE28 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
STKLD1Q8NE28 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.2 ms