Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BHLHE23Q8NDY6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BHLHE23Q8NDY6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BHLHE23Q8NDY6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BHLHE23Q8NDY6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BHLHE23Q8NDY6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BHLHE23Q8NDY6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BHLHE23Q8NDY6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BHLHE23Q8NDY6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BHLHE23Q8NDY6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BHLHE23Q8NDY6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BHLHE23Q8NDY6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BHLHE23Q8NDY6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BHLHE23Q8NDY6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BHLHE23Q8NDY6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BHLHE23Q8NDY6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BHLHE23Q8NDY6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BHLHE23Q8NDY6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BHLHE23Q8NDY6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BHLHE23Q8NDY6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BHLHE23Q8NDY6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
BHLHE23Q8NDY6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.11
BHLHE23Q8NDY6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BHLHE23Q8NDY6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BHLHE23Q8NDY6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BHLHE23Q8NDY6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BHLHE23Q8NDY6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BHLHE23Q8NDY6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BHLHE23Q8NDY6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BHLHE23Q8NDY6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BHLHE23Q8NDY6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
BHLHE23Q8NDY6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BHLHE23Q8NDY6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BHLHE23Q8NDY6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BHLHE23Q8NDY6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BHLHE23Q8NDY6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BHLHE23Q8NDY6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BHLHE23Q8NDY6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BHLHE23Q8NDY6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BHLHE23Q8NDY6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BHLHE23Q8NDY6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BHLHE23Q8NDY6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BHLHE23Q8NDY6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BHLHE23Q8NDY6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BHLHE23Q8NDY6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BHLHE23Q8NDY6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BHLHE23Q8NDY6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BHLHE23Q8NDY6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BHLHE23Q8NDY6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BHLHE23Q8NDY6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BHLHE23Q8NDY6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BHLHE23Q8NDY6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BHLHE23Q8NDY6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BHLHE23Q8NDY6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BHLHE23Q8NDY6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BHLHE23Q8NDY6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BHLHE23Q8NDY6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
BHLHE23Q8NDY6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BHLHE23Q8NDY6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BHLHE23Q8NDY6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BHLHE23Q8NDY6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BHLHE23Q8NDY6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BHLHE23Q8NDY6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BHLHE23Q8NDY6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BHLHE23Q8NDY6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BHLHE23Q8NDY6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
BHLHE23Q8NDY6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BHLHE23Q8NDY6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BHLHE23Q8NDY6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BHLHE23Q8NDY6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BHLHE23Q8NDY6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BHLHE23Q8NDY6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BHLHE23Q8NDY6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BHLHE23Q8NDY6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BHLHE23Q8NDY6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BHLHE23Q8NDY6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BHLHE23Q8NDY6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BHLHE23Q8NDY6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BHLHE23Q8NDY6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BHLHE23Q8NDY6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
BHLHE23Q8NDY6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BHLHE23Q8NDY6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BHLHE23Q8NDY6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BHLHE23Q8NDY6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BHLHE23Q8NDY6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BHLHE23Q8NDY6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BHLHE23Q8NDY6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BHLHE23Q8NDY6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BHLHE23Q8NDY6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
BHLHE23Q8NDY6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BHLHE23Q8NDY6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BHLHE23Q8NDY6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BHLHE23Q8NDY6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BHLHE23Q8NDY6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BHLHE23Q8NDY6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BHLHE23Q8NDY6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BHLHE23Q8NDY6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BHLHE23Q8NDY6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BHLHE23Q8NDY6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BHLHE23Q8NDY6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms