Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF248Q8NDW4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF248Q8NDW4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF248Q8NDW4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF248Q8NDW4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF248Q8NDW4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF248Q8NDW4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF248Q8NDW4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF248Q8NDW4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF248Q8NDW4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF248Q8NDW4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF248Q8NDW4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF248Q8NDW4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF248Q8NDW4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF248Q8NDW4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF248Q8NDW4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF248Q8NDW4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF248Q8NDW4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF248Q8NDW4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF248Q8NDW4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF248Q8NDW4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF248Q8NDW4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF248Q8NDW4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF248Q8NDW4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF248Q8NDW4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF248Q8NDW4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF248Q8NDW4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF248Q8NDW4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF248Q8NDW4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF248Q8NDW4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF248Q8NDW4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF248Q8NDW4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF248Q8NDW4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF248Q8NDW4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF248Q8NDW4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF248Q8NDW4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF248Q8NDW4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF248Q8NDW4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF248Q8NDW4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF248Q8NDW4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF248Q8NDW4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF248Q8NDW4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF248Q8NDW4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF248Q8NDW4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF248Q8NDW4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF248Q8NDW4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF248Q8NDW4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF248Q8NDW4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF248Q8NDW4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF248Q8NDW4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF248Q8NDW4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
ZNF248Q8NDW4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF248Q8NDW4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF248Q8NDW4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF248Q8NDW4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF248Q8NDW4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF248Q8NDW4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF248Q8NDW4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF248Q8NDW4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF248Q8NDW4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF248Q8NDW4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF248Q8NDW4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF248Q8NDW4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF248Q8NDW4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF248Q8NDW4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF248Q8NDW4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF248Q8NDW4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZNF248Q8NDW4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF248Q8NDW4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF248Q8NDW4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF248Q8NDW4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF248Q8NDW4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF248Q8NDW4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF248Q8NDW4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF248Q8NDW4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF248Q8NDW4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF248Q8NDW4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF248Q8NDW4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF248Q8NDW4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF248Q8NDW4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF248Q8NDW4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF248Q8NDW4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF248Q8NDW4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF248Q8NDW4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF248Q8NDW4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF248Q8NDW4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF248Q8NDW4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF248Q8NDW4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF248Q8NDW4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF248Q8NDW4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF248Q8NDW4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF248Q8NDW4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF248Q8NDW4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF248Q8NDW4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF248Q8NDW4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF248Q8NDW4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF248Q8NDW4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF248Q8NDW4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF248Q8NDW4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF248Q8NDW4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.5 ms