Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCL9

APCDD1L, Protein APCDD1-like, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCDD1LQ8NCL9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
APCDD1LQ8NCL9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APCDD1LQ8NCL9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APCDD1LQ8NCL9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APCDD1LQ8NCL9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
APCDD1LQ8NCL9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APCDD1LQ8NCL9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APCDD1LQ8NCL9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
APCDD1LQ8NCL9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
APCDD1LQ8NCL9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
APCDD1LQ8NCL9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
APCDD1LQ8NCL9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
APCDD1LQ8NCL9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
APCDD1LQ8NCL9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
APCDD1LQ8NCL9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
APCDD1LQ8NCL9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
APCDD1LQ8NCL9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APCDD1LQ8NCL9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
APCDD1LQ8NCL9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
APCDD1LQ8NCL9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APCDD1LQ8NCL9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APCDD1LQ8NCL9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
APCDD1LQ8NCL9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APCDD1LQ8NCL9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APCDD1LQ8NCL9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APCDD1LQ8NCL9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APCDD1LQ8NCL9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APCDD1LQ8NCL9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APCDD1LQ8NCL9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APCDD1LQ8NCL9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APCDD1LQ8NCL9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APCDD1LQ8NCL9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APCDD1LQ8NCL9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APCDD1LQ8NCL9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APCDD1LQ8NCL9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APCDD1LQ8NCL9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APCDD1LQ8NCL9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APCDD1LQ8NCL9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APCDD1LQ8NCL9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APCDD1LQ8NCL9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APCDD1LQ8NCL9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
APCDD1LQ8NCL9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
APCDD1LQ8NCL9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
APCDD1LQ8NCL9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
APCDD1LQ8NCL9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
APCDD1LQ8NCL9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APCDD1LQ8NCL9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
APCDD1LQ8NCL9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APCDD1LQ8NCL9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APCDD1LQ8NCL9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APCDD1LQ8NCL9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
APCDD1LQ8NCL9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APCDD1LQ8NCL9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APCDD1LQ8NCL9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APCDD1LQ8NCL9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APCDD1LQ8NCL9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APCDD1LQ8NCL9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APCDD1LQ8NCL9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APCDD1LQ8NCL9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APCDD1LQ8NCL9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
APCDD1LQ8NCL9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
APCDD1LQ8NCL9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APCDD1LQ8NCL9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APCDD1LQ8NCL9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
APCDD1LQ8NCL9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APCDD1LQ8NCL9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APCDD1LQ8NCL9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APCDD1LQ8NCL9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APCDD1LQ8NCL9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
APCDD1LQ8NCL9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
APCDD1LQ8NCL9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APCDD1LQ8NCL9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
APCDD1LQ8NCL9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
APCDD1LQ8NCL9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
APCDD1LQ8NCL9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
APCDD1LQ8NCL9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
APCDD1LQ8NCL9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APCDD1LQ8NCL9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APCDD1LQ8NCL9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APCDD1LQ8NCL9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APCDD1LQ8NCL9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APCDD1LQ8NCL9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APCDD1LQ8NCL9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APCDD1LQ8NCL9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APCDD1LQ8NCL9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
APCDD1LQ8NCL9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APCDD1LQ8NCL9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APCDD1LQ8NCL9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APCDD1LQ8NCL9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APCDD1LQ8NCL9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
APCDD1LQ8NCL9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APCDD1LQ8NCL9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APCDD1LQ8NCL9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APCDD1LQ8NCL9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APCDD1LQ8NCL9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APCDD1LQ8NCL9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APCDD1LQ8NCL9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APCDD1LQ8NCL9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
APCDD1LQ8NCL9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
APCDD1LQ8NCL9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms