Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCK3

ZNF485, Zinc finger protein 485, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF485Q8NCK3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF485Q8NCK3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF485Q8NCK3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF485Q8NCK3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF485Q8NCK3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF485Q8NCK3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF485Q8NCK3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF485Q8NCK3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF485Q8NCK3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF485Q8NCK3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF485Q8NCK3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF485Q8NCK3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF485Q8NCK3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF485Q8NCK3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ZNF485Q8NCK3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ZNF485Q8NCK3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF485Q8NCK3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF485Q8NCK3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF485Q8NCK3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF485Q8NCK3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF485Q8NCK3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF485Q8NCK3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF485Q8NCK3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF485Q8NCK3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF485Q8NCK3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF485Q8NCK3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF485Q8NCK3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF485Q8NCK3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF485Q8NCK3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF485Q8NCK3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF485Q8NCK3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF485Q8NCK3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF485Q8NCK3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF485Q8NCK3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF485Q8NCK3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF485Q8NCK3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF485Q8NCK3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF485Q8NCK3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF485Q8NCK3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF485Q8NCK3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF485Q8NCK3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF485Q8NCK3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF485Q8NCK3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF485Q8NCK3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF485Q8NCK3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF485Q8NCK3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZNF485Q8NCK3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZNF485Q8NCK3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF485Q8NCK3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF485Q8NCK3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF485Q8NCK3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF485Q8NCK3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF485Q8NCK3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF485Q8NCK3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF485Q8NCK3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF485Q8NCK3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF485Q8NCK3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF485Q8NCK3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF485Q8NCK3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF485Q8NCK3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF485Q8NCK3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF485Q8NCK3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF485Q8NCK3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF485Q8NCK3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF485Q8NCK3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF485Q8NCK3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF485Q8NCK3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF485Q8NCK3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF485Q8NCK3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF485Q8NCK3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF485Q8NCK3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF485Q8NCK3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF485Q8NCK3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF485Q8NCK3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF485Q8NCK3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF485Q8NCK3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF485Q8NCK3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF485Q8NCK3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF485Q8NCK3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF485Q8NCK3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF485Q8NCK3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF485Q8NCK3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF485Q8NCK3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF485Q8NCK3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF485Q8NCK3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF485Q8NCK3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF485Q8NCK3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF485Q8NCK3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF485Q8NCK3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF485Q8NCK3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF485Q8NCK3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF485Q8NCK3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF485Q8NCK3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF485Q8NCK3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF485Q8NCK3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF485Q8NCK3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF485Q8NCK3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF485Q8NCK3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF485Q8NCK3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF485Q8NCK3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms