Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN7

RDH13, Retinol dehydrogenase 13, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH13Q8NBN7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RDH13Q8NBN7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RDH13Q8NBN7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RDH13Q8NBN7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RDH13Q8NBN7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RDH13Q8NBN7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RDH13Q8NBN7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RDH13Q8NBN7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RDH13Q8NBN7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RDH13Q8NBN7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RDH13Q8NBN7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
RDH13Q8NBN7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
RDH13Q8NBN7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
RDH13Q8NBN7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RDH13Q8NBN7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
RDH13Q8NBN7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RDH13Q8NBN7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RDH13Q8NBN7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RDH13Q8NBN7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RDH13Q8NBN7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RDH13Q8NBN7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RDH13Q8NBN7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RDH13Q8NBN7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RDH13Q8NBN7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RDH13Q8NBN7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RDH13Q8NBN7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RDH13Q8NBN7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RDH13Q8NBN7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RDH13Q8NBN7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RDH13Q8NBN7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RDH13Q8NBN7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RDH13Q8NBN7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RDH13Q8NBN7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
RDH13Q8NBN7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RDH13Q8NBN7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RDH13Q8NBN7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RDH13Q8NBN7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RDH13Q8NBN7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
RDH13Q8NBN7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RDH13Q8NBN7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RDH13Q8NBN7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RDH13Q8NBN7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RDH13Q8NBN7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RDH13Q8NBN7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RDH13Q8NBN7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RDH13Q8NBN7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RDH13Q8NBN7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RDH13Q8NBN7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RDH13Q8NBN7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
RDH13Q8NBN7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RDH13Q8NBN7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RDH13Q8NBN7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
RDH13Q8NBN7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
RDH13Q8NBN7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
RDH13Q8NBN7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
RDH13Q8NBN7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
RDH13Q8NBN7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
RDH13Q8NBN7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
RDH13Q8NBN7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
RDH13Q8NBN7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
RDH13Q8NBN7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RDH13Q8NBN7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RDH13Q8NBN7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RDH13Q8NBN7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RDH13Q8NBN7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RDH13Q8NBN7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RDH13Q8NBN7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RDH13Q8NBN7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RDH13Q8NBN7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RDH13Q8NBN7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RDH13Q8NBN7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RDH13Q8NBN7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RDH13Q8NBN7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RDH13Q8NBN7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RDH13Q8NBN7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RDH13Q8NBN7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RDH13Q8NBN7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RDH13Q8NBN7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RDH13Q8NBN7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RDH13Q8NBN7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RDH13Q8NBN7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RDH13Q8NBN7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RDH13Q8NBN7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RDH13Q8NBN7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RDH13Q8NBN7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RDH13Q8NBN7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RDH13Q8NBN7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RDH13Q8NBN7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RDH13Q8NBN7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RDH13Q8NBN7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RDH13Q8NBN7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RDH13Q8NBN7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RDH13Q8NBN7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RDH13Q8NBN7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RDH13Q8NBN7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RDH13Q8NBN7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RDH13Q8NBN7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RDH13Q8NBN7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RDH13Q8NBN7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RDH13Q8NBN7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms