Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V2

TRIML1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIML1, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIML1Q8N9V2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIML1Q8N9V2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIML1Q8N9V2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIML1Q8N9V2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIML1Q8N9V2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIML1Q8N9V2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIML1Q8N9V2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIML1Q8N9V2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIML1Q8N9V2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIML1Q8N9V2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIML1Q8N9V2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIML1Q8N9V2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIML1Q8N9V2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIML1Q8N9V2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIML1Q8N9V2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIML1Q8N9V2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIML1Q8N9V2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIML1Q8N9V2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIML1Q8N9V2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIML1Q8N9V2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIML1Q8N9V2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIML1Q8N9V2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIML1Q8N9V2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIML1Q8N9V2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIML1Q8N9V2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIML1Q8N9V2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIML1Q8N9V2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIML1Q8N9V2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIML1Q8N9V2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIML1Q8N9V2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIML1Q8N9V2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIML1Q8N9V2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIML1Q8N9V2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIML1Q8N9V2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIML1Q8N9V2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIML1Q8N9V2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIML1Q8N9V2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIML1Q8N9V2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIML1Q8N9V2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIML1Q8N9V2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIML1Q8N9V2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIML1Q8N9V2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIML1Q8N9V2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIML1Q8N9V2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIML1Q8N9V2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIML1Q8N9V2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIML1Q8N9V2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIML1Q8N9V2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRIML1Q8N9V2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIML1Q8N9V2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIML1Q8N9V2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIML1Q8N9V2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIML1Q8N9V2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIML1Q8N9V2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRIML1Q8N9V2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRIML1Q8N9V2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRIML1Q8N9V2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRIML1Q8N9V2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIML1Q8N9V2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIML1Q8N9V2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIML1Q8N9V2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIML1Q8N9V2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIML1Q8N9V2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRIML1Q8N9V2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRIML1Q8N9V2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRIML1Q8N9V2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
TRIML1Q8N9V2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIML1Q8N9V2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIML1Q8N9V2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIML1Q8N9V2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIML1Q8N9V2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIML1Q8N9V2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIML1Q8N9V2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIML1Q8N9V2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIML1Q8N9V2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIML1Q8N9V2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIML1Q8N9V2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIML1Q8N9V2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIML1Q8N9V2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIML1Q8N9V2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRIML1Q8N9V2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRIML1Q8N9V2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIML1Q8N9V2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIML1Q8N9V2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIML1Q8N9V2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIML1Q8N9V2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIML1Q8N9V2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
TRIML1Q8N9V2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIML1Q8N9V2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIML1Q8N9V2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIML1Q8N9V2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIML1Q8N9V2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIML1Q8N9V2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIML1Q8N9V2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIML1Q8N9V2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIML1Q8N9V2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIML1Q8N9V2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIML1Q8N9V2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIML1Q8N9V2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIML1Q8N9V2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms