Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6L0

CCDC155, Protein KASH5, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC155Q8N6L0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC155Q8N6L0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC155Q8N6L0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC155Q8N6L0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC155Q8N6L0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC155Q8N6L0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC155Q8N6L0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC155Q8N6L0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC155Q8N6L0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC155Q8N6L0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC155Q8N6L0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC155Q8N6L0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC155Q8N6L0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC155Q8N6L0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC155Q8N6L0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC155Q8N6L0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC155Q8N6L0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC155Q8N6L0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC155Q8N6L0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC155Q8N6L0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC155Q8N6L0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC155Q8N6L0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC155Q8N6L0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC155Q8N6L0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC155Q8N6L0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC155Q8N6L0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC155Q8N6L0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC155Q8N6L0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC155Q8N6L0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC155Q8N6L0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC155Q8N6L0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC155Q8N6L0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC155Q8N6L0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC155Q8N6L0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC155Q8N6L0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC155Q8N6L0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC155Q8N6L0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC155Q8N6L0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC155Q8N6L0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC155Q8N6L0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC155Q8N6L0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC155Q8N6L0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC155Q8N6L0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC155Q8N6L0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC155Q8N6L0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC155Q8N6L0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC155Q8N6L0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC155Q8N6L0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC155Q8N6L0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC155Q8N6L0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC155Q8N6L0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC155Q8N6L0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC155Q8N6L0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC155Q8N6L0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC155Q8N6L0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC155Q8N6L0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC155Q8N6L0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC155Q8N6L0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC155Q8N6L0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC155Q8N6L0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC155Q8N6L0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC155Q8N6L0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC155Q8N6L0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC155Q8N6L0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC155Q8N6L0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC155Q8N6L0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC155Q8N6L0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC155Q8N6L0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC155Q8N6L0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC155Q8N6L0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC155Q8N6L0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC155Q8N6L0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC155Q8N6L0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC155Q8N6L0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC155Q8N6L0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC155Q8N6L0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC155Q8N6L0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC155Q8N6L0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC155Q8N6L0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC155Q8N6L0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC155Q8N6L0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC155Q8N6L0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC155Q8N6L0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC155Q8N6L0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC155Q8N6L0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC155Q8N6L0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC155Q8N6L0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC155Q8N6L0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC155Q8N6L0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC155Q8N6L0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC155Q8N6L0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC155Q8N6L0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC155Q8N6L0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CCDC155Q8N6L0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CCDC155Q8N6L0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC155Q8N6L0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC155Q8N6L0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC155Q8N6L0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC155Q8N6L0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC155Q8N6L0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms