Protein–RNA interactions for Protein: Q8N511

TMEM199, Transmembrane protein 199, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM199Q8N511 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
TMEM199Q8N511 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMEM199Q8N511 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMEM199Q8N511 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMEM199Q8N511 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMEM199Q8N511 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMEM199Q8N511 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
TMEM199Q8N511 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMEM199Q8N511 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMEM199Q8N511 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMEM199Q8N511 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMEM199Q8N511 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMEM199Q8N511 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMEM199Q8N511 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMEM199Q8N511 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMEM199Q8N511 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMEM199Q8N511 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMEM199Q8N511 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMEM199Q8N511 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMEM199Q8N511 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMEM199Q8N511 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMEM199Q8N511 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMEM199Q8N511 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMEM199Q8N511 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMEM199Q8N511 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMEM199Q8N511 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMEM199Q8N511 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMEM199Q8N511 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMEM199Q8N511 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMEM199Q8N511 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMEM199Q8N511 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMEM199Q8N511 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMEM199Q8N511 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMEM199Q8N511 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMEM199Q8N511 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMEM199Q8N511 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TMEM199Q8N511 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TMEM199Q8N511 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TMEM199Q8N511 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TMEM199Q8N511 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
TMEM199Q8N511 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TMEM199Q8N511 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMEM199Q8N511 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMEM199Q8N511 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMEM199Q8N511 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMEM199Q8N511 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMEM199Q8N511 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMEM199Q8N511 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMEM199Q8N511 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMEM199Q8N511 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
TMEM199Q8N511 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMEM199Q8N511 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMEM199Q8N511 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMEM199Q8N511 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMEM199Q8N511 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMEM199Q8N511 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMEM199Q8N511 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMEM199Q8N511 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMEM199Q8N511 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMEM199Q8N511 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
TMEM199Q8N511 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TMEM199Q8N511 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
TMEM199Q8N511 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMEM199Q8N511 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMEM199Q8N511 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMEM199Q8N511 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMEM199Q8N511 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMEM199Q8N511 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TMEM199Q8N511 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMEM199Q8N511 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMEM199Q8N511 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMEM199Q8N511 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TMEM199Q8N511 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMEM199Q8N511 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMEM199Q8N511 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMEM199Q8N511 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMEM199Q8N511 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
TMEM199Q8N511 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMEM199Q8N511 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMEM199Q8N511 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMEM199Q8N511 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TMEM199Q8N511 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TMEM199Q8N511 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
TMEM199Q8N511 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
TMEM199Q8N511 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMEM199Q8N511 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMEM199Q8N511 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMEM199Q8N511 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMEM199Q8N511 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMEM199Q8N511 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMEM199Q8N511 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMEM199Q8N511 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMEM199Q8N511 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMEM199Q8N511 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMEM199Q8N511 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMEM199Q8N511 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMEM199Q8N511 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMEM199Q8N511 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMEM199Q8N511 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
TMEM199Q8N511 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms