Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHCHD4Q8N4Q1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHCHD4Q8N4Q1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHCHD4Q8N4Q1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHCHD4Q8N4Q1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHCHD4Q8N4Q1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHCHD4Q8N4Q1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHCHD4Q8N4Q1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHCHD4Q8N4Q1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHCHD4Q8N4Q1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHCHD4Q8N4Q1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHCHD4Q8N4Q1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHCHD4Q8N4Q1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHCHD4Q8N4Q1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHCHD4Q8N4Q1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHCHD4Q8N4Q1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHCHD4Q8N4Q1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHCHD4Q8N4Q1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHCHD4Q8N4Q1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHCHD4Q8N4Q1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHCHD4Q8N4Q1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHCHD4Q8N4Q1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CHCHD4Q8N4Q1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CHCHD4Q8N4Q1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHCHD4Q8N4Q1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHCHD4Q8N4Q1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHCHD4Q8N4Q1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHCHD4Q8N4Q1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHCHD4Q8N4Q1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CHCHD4Q8N4Q1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHCHD4Q8N4Q1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHCHD4Q8N4Q1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHCHD4Q8N4Q1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHCHD4Q8N4Q1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CHCHD4Q8N4Q1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHCHD4Q8N4Q1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHCHD4Q8N4Q1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHCHD4Q8N4Q1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHCHD4Q8N4Q1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CHCHD4Q8N4Q1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHCHD4Q8N4Q1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHCHD4Q8N4Q1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHCHD4Q8N4Q1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHCHD4Q8N4Q1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHCHD4Q8N4Q1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHCHD4Q8N4Q1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHCHD4Q8N4Q1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CHCHD4Q8N4Q1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHCHD4Q8N4Q1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHCHD4Q8N4Q1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHCHD4Q8N4Q1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CHCHD4Q8N4Q1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHCHD4Q8N4Q1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHCHD4Q8N4Q1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHCHD4Q8N4Q1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHCHD4Q8N4Q1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHCHD4Q8N4Q1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHCHD4Q8N4Q1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHCHD4Q8N4Q1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHCHD4Q8N4Q1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHCHD4Q8N4Q1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHCHD4Q8N4Q1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHCHD4Q8N4Q1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHCHD4Q8N4Q1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHCHD4Q8N4Q1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHCHD4Q8N4Q1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHCHD4Q8N4Q1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHCHD4Q8N4Q1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHCHD4Q8N4Q1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHCHD4Q8N4Q1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHCHD4Q8N4Q1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHCHD4Q8N4Q1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHCHD4Q8N4Q1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHCHD4Q8N4Q1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHCHD4Q8N4Q1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHCHD4Q8N4Q1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHCHD4Q8N4Q1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHCHD4Q8N4Q1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHCHD4Q8N4Q1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHCHD4Q8N4Q1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHCHD4Q8N4Q1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHCHD4Q8N4Q1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CHCHD4Q8N4Q1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHCHD4Q8N4Q1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHCHD4Q8N4Q1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CHCHD4Q8N4Q1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHCHD4Q8N4Q1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHCHD4Q8N4Q1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHCHD4Q8N4Q1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHCHD4Q8N4Q1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHCHD4Q8N4Q1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHCHD4Q8N4Q1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHCHD4Q8N4Q1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHCHD4Q8N4Q1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHCHD4Q8N4Q1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
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