Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3Y7

SDR16C5, Epidermal retinol dehydrogenase 2, humanhuman

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR16C5Q8N3Y7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SDR16C5Q8N3Y7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SDR16C5Q8N3Y7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SDR16C5Q8N3Y7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SDR16C5Q8N3Y7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SDR16C5Q8N3Y7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SDR16C5Q8N3Y7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SDR16C5Q8N3Y7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SDR16C5Q8N3Y7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SDR16C5Q8N3Y7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SDR16C5Q8N3Y7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SDR16C5Q8N3Y7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SDR16C5Q8N3Y7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SDR16C5Q8N3Y7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SDR16C5Q8N3Y7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SDR16C5Q8N3Y7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SDR16C5Q8N3Y7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SDR16C5Q8N3Y7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SDR16C5Q8N3Y7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SDR16C5Q8N3Y7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SDR16C5Q8N3Y7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SDR16C5Q8N3Y7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SDR16C5Q8N3Y7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SDR16C5Q8N3Y7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SDR16C5Q8N3Y7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SDR16C5Q8N3Y7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SDR16C5Q8N3Y7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SDR16C5Q8N3Y7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SDR16C5Q8N3Y7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SDR16C5Q8N3Y7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SDR16C5Q8N3Y7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SDR16C5Q8N3Y7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SDR16C5Q8N3Y7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SDR16C5Q8N3Y7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SDR16C5Q8N3Y7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SDR16C5Q8N3Y7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SDR16C5Q8N3Y7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SDR16C5Q8N3Y7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SDR16C5Q8N3Y7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SDR16C5Q8N3Y7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SDR16C5Q8N3Y7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SDR16C5Q8N3Y7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SDR16C5Q8N3Y7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SDR16C5Q8N3Y7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SDR16C5Q8N3Y7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SDR16C5Q8N3Y7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SDR16C5Q8N3Y7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SDR16C5Q8N3Y7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SDR16C5Q8N3Y7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SDR16C5Q8N3Y7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SDR16C5Q8N3Y7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SDR16C5Q8N3Y7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SDR16C5Q8N3Y7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SDR16C5Q8N3Y7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SDR16C5Q8N3Y7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SDR16C5Q8N3Y7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SDR16C5Q8N3Y7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SDR16C5Q8N3Y7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SDR16C5Q8N3Y7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SDR16C5Q8N3Y7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SDR16C5Q8N3Y7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SDR16C5Q8N3Y7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SDR16C5Q8N3Y7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SDR16C5Q8N3Y7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SDR16C5Q8N3Y7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SDR16C5Q8N3Y7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SDR16C5Q8N3Y7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SDR16C5Q8N3Y7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SDR16C5Q8N3Y7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SDR16C5Q8N3Y7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SDR16C5Q8N3Y7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SDR16C5Q8N3Y7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SDR16C5Q8N3Y7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SDR16C5Q8N3Y7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SDR16C5Q8N3Y7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SDR16C5Q8N3Y7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SDR16C5Q8N3Y7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SDR16C5Q8N3Y7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SDR16C5Q8N3Y7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SDR16C5Q8N3Y7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SDR16C5Q8N3Y7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SDR16C5Q8N3Y7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SDR16C5Q8N3Y7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SDR16C5Q8N3Y7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SDR16C5Q8N3Y7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SDR16C5Q8N3Y7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SDR16C5Q8N3Y7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SDR16C5Q8N3Y7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SDR16C5Q8N3Y7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SDR16C5Q8N3Y7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SDR16C5Q8N3Y7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SDR16C5Q8N3Y7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SDR16C5Q8N3Y7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SDR16C5Q8N3Y7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SDR16C5Q8N3Y7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SDR16C5Q8N3Y7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SDR16C5Q8N3Y7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SDR16C5Q8N3Y7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SDR16C5Q8N3Y7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SDR16C5Q8N3Y7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
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