Protein–RNA interactions for Protein: Q8N309

LRRC43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC43Q8N309 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC43Q8N309 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.53■■■□□ 2
LRRC43Q8N309 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC43Q8N309 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.52■■■□□ 2
LRRC43Q8N309 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC43Q8N309 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC43Q8N309 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC43Q8N309 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC43Q8N309 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC43Q8N309 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC43Q8N309 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
LRRC43Q8N309 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
LRRC43Q8N309 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC43Q8N309 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC43Q8N309 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC43Q8N309 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC43Q8N309 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC43Q8N309 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRC43Q8N309 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRC43Q8N309 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC43Q8N309 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC43Q8N309 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC43Q8N309 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC43Q8N309 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC43Q8N309 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC43Q8N309 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC43Q8N309 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRC43Q8N309 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRC43Q8N309 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRC43Q8N309 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRC43Q8N309 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRC43Q8N309 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRC43Q8N309 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRC43Q8N309 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRC43Q8N309 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LRRC43Q8N309 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRC43Q8N309 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRC43Q8N309 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRC43Q8N309 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRC43Q8N309 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRC43Q8N309 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRC43Q8N309 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRC43Q8N309 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRC43Q8N309 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRC43Q8N309 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRC43Q8N309 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRC43Q8N309 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC43Q8N309 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC43Q8N309 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC43Q8N309 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC43Q8N309 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC43Q8N309 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC43Q8N309 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC43Q8N309 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRC43Q8N309 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRC43Q8N309 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRC43Q8N309 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRC43Q8N309 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRC43Q8N309 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRC43Q8N309 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRC43Q8N309 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRC43Q8N309 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRC43Q8N309 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRC43Q8N309 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRC43Q8N309 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRC43Q8N309 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRC43Q8N309 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRC43Q8N309 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRC43Q8N309 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRC43Q8N309 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRC43Q8N309 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRC43Q8N309 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRC43Q8N309 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRC43Q8N309 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRC43Q8N309 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRC43Q8N309 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRC43Q8N309 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC43Q8N309 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC43Q8N309 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC43Q8N309 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC43Q8N309 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC43Q8N309 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC43Q8N309 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRC43Q8N309 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRC43Q8N309 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRC43Q8N309 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRC43Q8N309 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRC43Q8N309 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRC43Q8N309 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRC43Q8N309 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRC43Q8N309 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRC43Q8N309 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRC43Q8N309 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRC43Q8N309 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRC43Q8N309 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRC43Q8N309 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRC43Q8N309 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRRC43Q8N309 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRRC43Q8N309 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRRC43Q8N309 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms