Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1G4

LRRC47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC47Q8N1G4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
LRRC47Q8N1G4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
LRRC47Q8N1G4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
LRRC47Q8N1G4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
LRRC47Q8N1G4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LRRC47Q8N1G4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
LRRC47Q8N1G4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
LRRC47Q8N1G4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
LRRC47Q8N1G4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
LRRC47Q8N1G4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
LRRC47Q8N1G4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
LRRC47Q8N1G4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
LRRC47Q8N1G4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
LRRC47Q8N1G4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
LRRC47Q8N1G4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
LRRC47Q8N1G4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
LRRC47Q8N1G4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
LRRC47Q8N1G4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
LRRC47Q8N1G4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
LRRC47Q8N1G4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
LRRC47Q8N1G4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
LRRC47Q8N1G4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
LRRC47Q8N1G4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
LRRC47Q8N1G4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
LRRC47Q8N1G4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
LRRC47Q8N1G4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
LRRC47Q8N1G4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
LRRC47Q8N1G4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
LRRC47Q8N1G4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
LRRC47Q8N1G4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
LRRC47Q8N1G4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
LRRC47Q8N1G4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
LRRC47Q8N1G4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
LRRC47Q8N1G4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
LRRC47Q8N1G4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
LRRC47Q8N1G4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
LRRC47Q8N1G4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
LRRC47Q8N1G4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
LRRC47Q8N1G4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
LRRC47Q8N1G4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
LRRC47Q8N1G4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
LRRC47Q8N1G4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
LRRC47Q8N1G4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
LRRC47Q8N1G4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
LRRC47Q8N1G4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
LRRC47Q8N1G4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
LRRC47Q8N1G4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
LRRC47Q8N1G4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
LRRC47Q8N1G4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
LRRC47Q8N1G4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
LRRC47Q8N1G4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
LRRC47Q8N1G4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
LRRC47Q8N1G4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
LRRC47Q8N1G4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
LRRC47Q8N1G4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
LRRC47Q8N1G4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
LRRC47Q8N1G4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
LRRC47Q8N1G4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
LRRC47Q8N1G4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
LRRC47Q8N1G4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
LRRC47Q8N1G4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LRRC47Q8N1G4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LRRC47Q8N1G4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
LRRC47Q8N1G4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
LRRC47Q8N1G4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
LRRC47Q8N1G4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
LRRC47Q8N1G4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LRRC47Q8N1G4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
LRRC47Q8N1G4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LRRC47Q8N1G4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LRRC47Q8N1G4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
LRRC47Q8N1G4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
LRRC47Q8N1G4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
LRRC47Q8N1G4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
LRRC47Q8N1G4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
LRRC47Q8N1G4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
LRRC47Q8N1G4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
LRRC47Q8N1G4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
LRRC47Q8N1G4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
LRRC47Q8N1G4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
LRRC47Q8N1G4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LRRC47Q8N1G4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
LRRC47Q8N1G4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LRRC47Q8N1G4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
LRRC47Q8N1G4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LRRC47Q8N1G4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LRRC47Q8N1G4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LRRC47Q8N1G4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LRRC47Q8N1G4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
LRRC47Q8N1G4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
LRRC47Q8N1G4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LRRC47Q8N1G4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
LRRC47Q8N1G4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LRRC47Q8N1G4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LRRC47Q8N1G4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
LRRC47Q8N1G4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LRRC47Q8N1G4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LRRC47Q8N1G4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LRRC47Q8N1G4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LRRC47Q8N1G4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
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