Protein–RNA interactions for Protein: Q8N114

SHISA5, Protein shisa-5, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA5Q8N114 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHISA5Q8N114 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHISA5Q8N114 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHISA5Q8N114 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHISA5Q8N114 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHISA5Q8N114 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHISA5Q8N114 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SHISA5Q8N114 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SHISA5Q8N114 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SHISA5Q8N114 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SHISA5Q8N114 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SHISA5Q8N114 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SHISA5Q8N114 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHISA5Q8N114 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHISA5Q8N114 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHISA5Q8N114 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHISA5Q8N114 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SHISA5Q8N114 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHISA5Q8N114 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHISA5Q8N114 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHISA5Q8N114 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHISA5Q8N114 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHISA5Q8N114 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHISA5Q8N114 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SHISA5Q8N114 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHISA5Q8N114 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHISA5Q8N114 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHISA5Q8N114 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SHISA5Q8N114 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SHISA5Q8N114 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHISA5Q8N114 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHISA5Q8N114 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHISA5Q8N114 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHISA5Q8N114 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SHISA5Q8N114 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHISA5Q8N114 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHISA5Q8N114 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHISA5Q8N114 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHISA5Q8N114 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SHISA5Q8N114 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SHISA5Q8N114 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SHISA5Q8N114 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SHISA5Q8N114 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SHISA5Q8N114 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SHISA5Q8N114 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SHISA5Q8N114 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SHISA5Q8N114 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SHISA5Q8N114 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SHISA5Q8N114 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SHISA5Q8N114 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SHISA5Q8N114 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SHISA5Q8N114 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SHISA5Q8N114 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SHISA5Q8N114 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SHISA5Q8N114 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SHISA5Q8N114 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SHISA5Q8N114 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SHISA5Q8N114 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SHISA5Q8N114 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHISA5Q8N114 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHISA5Q8N114 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHISA5Q8N114 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHISA5Q8N114 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHISA5Q8N114 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHISA5Q8N114 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHISA5Q8N114 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHISA5Q8N114 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHISA5Q8N114 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHISA5Q8N114 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SHISA5Q8N114 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SHISA5Q8N114 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SHISA5Q8N114 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SHISA5Q8N114 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SHISA5Q8N114 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SHISA5Q8N114 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SHISA5Q8N114 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SHISA5Q8N114 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SHISA5Q8N114 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SHISA5Q8N114 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SHISA5Q8N114 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SHISA5Q8N114 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SHISA5Q8N114 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SHISA5Q8N114 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SHISA5Q8N114 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SHISA5Q8N114 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SHISA5Q8N114 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SHISA5Q8N114 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHISA5Q8N114 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHISA5Q8N114 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHISA5Q8N114 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHISA5Q8N114 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHISA5Q8N114 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHISA5Q8N114 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHISA5Q8N114 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHISA5Q8N114 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHISA5Q8N114 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHISA5Q8N114 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SHISA5Q8N114 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SHISA5Q8N114 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SHISA5Q8N114 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms