Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0Z3

SPICE1, Spindle and centriole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPICE1Q8N0Z3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SPICE1Q8N0Z3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SPICE1Q8N0Z3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SPICE1Q8N0Z3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SPICE1Q8N0Z3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SPICE1Q8N0Z3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SPICE1Q8N0Z3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
SPICE1Q8N0Z3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SPICE1Q8N0Z3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SPICE1Q8N0Z3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SPICE1Q8N0Z3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SPICE1Q8N0Z3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SPICE1Q8N0Z3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SPICE1Q8N0Z3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SPICE1Q8N0Z3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SPICE1Q8N0Z3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SPICE1Q8N0Z3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SPICE1Q8N0Z3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SPICE1Q8N0Z3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SPICE1Q8N0Z3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SPICE1Q8N0Z3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SPICE1Q8N0Z3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SPICE1Q8N0Z3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SPICE1Q8N0Z3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SPICE1Q8N0Z3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SPICE1Q8N0Z3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SPICE1Q8N0Z3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SPICE1Q8N0Z3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SPICE1Q8N0Z3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SPICE1Q8N0Z3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SPICE1Q8N0Z3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SPICE1Q8N0Z3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SPICE1Q8N0Z3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
SPICE1Q8N0Z3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SPICE1Q8N0Z3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SPICE1Q8N0Z3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SPICE1Q8N0Z3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SPICE1Q8N0Z3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SPICE1Q8N0Z3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
SPICE1Q8N0Z3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SPICE1Q8N0Z3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SPICE1Q8N0Z3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
SPICE1Q8N0Z3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SPICE1Q8N0Z3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SPICE1Q8N0Z3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
SPICE1Q8N0Z3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SPICE1Q8N0Z3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SPICE1Q8N0Z3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
SPICE1Q8N0Z3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SPICE1Q8N0Z3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SPICE1Q8N0Z3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SPICE1Q8N0Z3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SPICE1Q8N0Z3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SPICE1Q8N0Z3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SPICE1Q8N0Z3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
SPICE1Q8N0Z3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SPICE1Q8N0Z3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SPICE1Q8N0Z3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SPICE1Q8N0Z3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SPICE1Q8N0Z3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SPICE1Q8N0Z3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SPICE1Q8N0Z3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SPICE1Q8N0Z3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
SPICE1Q8N0Z3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SPICE1Q8N0Z3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
SPICE1Q8N0Z3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SPICE1Q8N0Z3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SPICE1Q8N0Z3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SPICE1Q8N0Z3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SPICE1Q8N0Z3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SPICE1Q8N0Z3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SPICE1Q8N0Z3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
SPICE1Q8N0Z3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SPICE1Q8N0Z3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SPICE1Q8N0Z3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SPICE1Q8N0Z3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SPICE1Q8N0Z3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SPICE1Q8N0Z3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SPICE1Q8N0Z3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SPICE1Q8N0Z3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SPICE1Q8N0Z3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SPICE1Q8N0Z3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SPICE1Q8N0Z3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SPICE1Q8N0Z3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SPICE1Q8N0Z3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SPICE1Q8N0Z3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SPICE1Q8N0Z3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SPICE1Q8N0Z3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SPICE1Q8N0Z3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
SPICE1Q8N0Z3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SPICE1Q8N0Z3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SPICE1Q8N0Z3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SPICE1Q8N0Z3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SPICE1Q8N0Z3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SPICE1Q8N0Z3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SPICE1Q8N0Z3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SPICE1Q8N0Z3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SPICE1Q8N0Z3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SPICE1Q8N0Z3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SPICE1Q8N0Z3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.3 ms