Protein–RNA interactions for Protein: Q86VP3

PACS2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS2Q86VP3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PACS2Q86VP3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PACS2Q86VP3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PACS2Q86VP3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PACS2Q86VP3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PACS2Q86VP3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PACS2Q86VP3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PACS2Q86VP3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PACS2Q86VP3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PACS2Q86VP3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PACS2Q86VP3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PACS2Q86VP3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PACS2Q86VP3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PACS2Q86VP3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PACS2Q86VP3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PACS2Q86VP3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PACS2Q86VP3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PACS2Q86VP3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PACS2Q86VP3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PACS2Q86VP3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PACS2Q86VP3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PACS2Q86VP3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PACS2Q86VP3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PACS2Q86VP3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PACS2Q86VP3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PACS2Q86VP3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PACS2Q86VP3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PACS2Q86VP3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PACS2Q86VP3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PACS2Q86VP3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PACS2Q86VP3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PACS2Q86VP3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PACS2Q86VP3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PACS2Q86VP3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PACS2Q86VP3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PACS2Q86VP3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PACS2Q86VP3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PACS2Q86VP3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PACS2Q86VP3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PACS2Q86VP3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PACS2Q86VP3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PACS2Q86VP3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PACS2Q86VP3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PACS2Q86VP3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PACS2Q86VP3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PACS2Q86VP3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PACS2Q86VP3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PACS2Q86VP3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PACS2Q86VP3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PACS2Q86VP3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PACS2Q86VP3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PACS2Q86VP3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PACS2Q86VP3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PACS2Q86VP3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PACS2Q86VP3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PACS2Q86VP3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PACS2Q86VP3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PACS2Q86VP3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PACS2Q86VP3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PACS2Q86VP3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PACS2Q86VP3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PACS2Q86VP3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PACS2Q86VP3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PACS2Q86VP3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PACS2Q86VP3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PACS2Q86VP3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PACS2Q86VP3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PACS2Q86VP3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PACS2Q86VP3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PACS2Q86VP3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PACS2Q86VP3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PACS2Q86VP3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PACS2Q86VP3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PACS2Q86VP3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PACS2Q86VP3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PACS2Q86VP3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PACS2Q86VP3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PACS2Q86VP3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PACS2Q86VP3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PACS2Q86VP3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PACS2Q86VP3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PACS2Q86VP3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PACS2Q86VP3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PACS2Q86VP3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PACS2Q86VP3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PACS2Q86VP3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PACS2Q86VP3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PACS2Q86VP3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PACS2Q86VP3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PACS2Q86VP3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PACS2Q86VP3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PACS2Q86VP3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PACS2Q86VP3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PACS2Q86VP3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PACS2Q86VP3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PACS2Q86VP3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PACS2Q86VP3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PACS2Q86VP3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PACS2Q86VP3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PACS2Q86VP3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms