Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC42.76■■■■■ 4.44
PBRM1Q86U86 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
PBRM1Q86U86 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC42.73■■■■■ 4.43
PBRM1Q86U86 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
PBRM1Q86U86 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.73■■■■■ 4.43
PBRM1Q86U86 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.73■■■■■ 4.43
PBRM1Q86U86 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
PBRM1Q86U86 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
PBRM1Q86U86 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC42.71■■■■■ 4.43
PBRM1Q86U86 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
PBRM1Q86U86 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC42.7■■■■■ 4.43
PBRM1Q86U86 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
PBRM1Q86U86 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.69■■■■■ 4.42
PBRM1Q86U86 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.68■■■■■ 4.42
PBRM1Q86U86 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
PBRM1Q86U86 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
PBRM1Q86U86 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
PBRM1Q86U86 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.66■■■■■ 4.42
PBRM1Q86U86 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
PBRM1Q86U86 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
PBRM1Q86U86 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC42.65■■■■■ 4.42
PBRM1Q86U86 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
PBRM1Q86U86 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC42.65■■■■■ 4.42
PBRM1Q86U86 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.42
PBRM1Q86U86 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.63■■■■■ 4.42
PBRM1Q86U86 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.41
PBRM1Q86U86 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.41
PBRM1Q86U86 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC42.62■■■■■ 4.41
PBRM1Q86U86 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
PBRM1Q86U86 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
PBRM1Q86U86 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC42.61■■■■■ 4.41
PBRM1Q86U86 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
PBRM1Q86U86 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
PBRM1Q86U86 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
PBRM1Q86U86 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC42.59■■■■■ 4.41
PBRM1Q86U86 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC42.59■■■■■ 4.41
PBRM1Q86U86 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC42.59■■■■■ 4.41
PBRM1Q86U86 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.41
PBRM1Q86U86 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC42.57■■■■■ 4.41
PBRM1Q86U86 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC42.57■■■■■ 4.4
PBRM1Q86U86 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
PBRM1Q86U86 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC42.56■■■■■ 4.4
PBRM1Q86U86 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
PBRM1Q86U86 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC42.55■■■■■ 4.4
PBRM1Q86U86 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC42.54■■■■■ 4.4
PBRM1Q86U86 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
PBRM1Q86U86 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC42.53■■■■■ 4.4
PBRM1Q86U86 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
PBRM1Q86U86 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC42.52■■■■■ 4.4
PBRM1Q86U86 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
PBRM1Q86U86 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.39
PBRM1Q86U86 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC42.5■■■■■ 4.39
PBRM1Q86U86 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
PBRM1Q86U86 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC42.5■■■■■ 4.39
PBRM1Q86U86 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC42.48■■■■■ 4.39
PBRM1Q86U86 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC42.48■■■■■ 4.39
PBRM1Q86U86 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC42.48■■■■■ 4.39
PBRM1Q86U86 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
PBRM1Q86U86 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
PBRM1Q86U86 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
PBRM1Q86U86 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
PBRM1Q86U86 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.46■■■■■ 4.39
PBRM1Q86U86 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
PBRM1Q86U86 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
PBRM1Q86U86 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
PBRM1Q86U86 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC42.44■■■■■ 4.39
PBRM1Q86U86 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
PBRM1Q86U86 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.43■■■■■ 4.38
PBRM1Q86U86 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC42.43■■■■■ 4.38
PBRM1Q86U86 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
PBRM1Q86U86 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
PBRM1Q86U86 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
PBRM1Q86U86 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC42.41■■■■■ 4.38
PBRM1Q86U86 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC42.41■■■■■ 4.38
PBRM1Q86U86 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC42.41■■■■■ 4.38
PBRM1Q86U86 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
PBRM1Q86U86 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
PBRM1Q86U86 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
PBRM1Q86U86 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC42.4■■■■■ 4.38
PBRM1Q86U86 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC42.4■■■■■ 4.38
PBRM1Q86U86 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.4■■■■■ 4.38
PBRM1Q86U86 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
PBRM1Q86U86 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
PBRM1Q86U86 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.38
PBRM1Q86U86 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.37
PBRM1Q86U86 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC42.37■■■■■ 4.37
PBRM1Q86U86 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
PBRM1Q86U86 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC42.35■■■■■ 4.37
PBRM1Q86U86 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
PBRM1Q86U86 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
PBRM1Q86U86 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
PBRM1Q86U86 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.35■■■■■ 4.37
PBRM1Q86U86 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
PBRM1Q86U86 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC42.34■■■■■ 4.37
PBRM1Q86U86 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.33■■■■■ 4.37
PBRM1Q86U86 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
PBRM1Q86U86 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC42.33■■■■■ 4.37
PBRM1Q86U86 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC42.31■■■■■ 4.36
PBRM1Q86U86 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.31■■■■■ 4.36
PBRM1Q86U86 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms