Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7G1

CLNK, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNKQ7Z7G1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CLNKQ7Z7G1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLNKQ7Z7G1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLNKQ7Z7G1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLNKQ7Z7G1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLNKQ7Z7G1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLNKQ7Z7G1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLNKQ7Z7G1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLNKQ7Z7G1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLNKQ7Z7G1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLNKQ7Z7G1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLNKQ7Z7G1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLNKQ7Z7G1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLNKQ7Z7G1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLNKQ7Z7G1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CLNKQ7Z7G1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLNKQ7Z7G1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLNKQ7Z7G1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLNKQ7Z7G1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLNKQ7Z7G1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLNKQ7Z7G1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLNKQ7Z7G1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLNKQ7Z7G1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLNKQ7Z7G1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLNKQ7Z7G1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLNKQ7Z7G1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CLNKQ7Z7G1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLNKQ7Z7G1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLNKQ7Z7G1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLNKQ7Z7G1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLNKQ7Z7G1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CLNKQ7Z7G1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLNKQ7Z7G1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLNKQ7Z7G1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CLNKQ7Z7G1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLNKQ7Z7G1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CLNKQ7Z7G1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CLNKQ7Z7G1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CLNKQ7Z7G1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLNKQ7Z7G1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CLNKQ7Z7G1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLNKQ7Z7G1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLNKQ7Z7G1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CLNKQ7Z7G1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLNKQ7Z7G1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLNKQ7Z7G1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLNKQ7Z7G1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLNKQ7Z7G1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLNKQ7Z7G1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLNKQ7Z7G1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLNKQ7Z7G1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLNKQ7Z7G1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLNKQ7Z7G1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLNKQ7Z7G1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLNKQ7Z7G1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLNKQ7Z7G1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLNKQ7Z7G1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLNKQ7Z7G1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLNKQ7Z7G1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLNKQ7Z7G1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CLNKQ7Z7G1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLNKQ7Z7G1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLNKQ7Z7G1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CLNKQ7Z7G1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLNKQ7Z7G1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLNKQ7Z7G1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLNKQ7Z7G1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLNKQ7Z7G1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CLNKQ7Z7G1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLNKQ7Z7G1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLNKQ7Z7G1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLNKQ7Z7G1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLNKQ7Z7G1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLNKQ7Z7G1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLNKQ7Z7G1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLNKQ7Z7G1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLNKQ7Z7G1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLNKQ7Z7G1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLNKQ7Z7G1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLNKQ7Z7G1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLNKQ7Z7G1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLNKQ7Z7G1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLNKQ7Z7G1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLNKQ7Z7G1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLNKQ7Z7G1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLNKQ7Z7G1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLNKQ7Z7G1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLNKQ7Z7G1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLNKQ7Z7G1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLNKQ7Z7G1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLNKQ7Z7G1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLNKQ7Z7G1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLNKQ7Z7G1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLNKQ7Z7G1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLNKQ7Z7G1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLNKQ7Z7G1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLNKQ7Z7G1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLNKQ7Z7G1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLNKQ7Z7G1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLNKQ7Z7G1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.6 ms