Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5N4

SDK1, Protein sidekick-1, humanhuman

Predictions only

Length 2,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK1Q7Z5N4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SDK1Q7Z5N4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SDK1Q7Z5N4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SDK1Q7Z5N4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SDK1Q7Z5N4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SDK1Q7Z5N4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SDK1Q7Z5N4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SDK1Q7Z5N4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SDK1Q7Z5N4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SDK1Q7Z5N4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SDK1Q7Z5N4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SDK1Q7Z5N4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SDK1Q7Z5N4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SDK1Q7Z5N4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SDK1Q7Z5N4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SDK1Q7Z5N4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SDK1Q7Z5N4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SDK1Q7Z5N4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SDK1Q7Z5N4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SDK1Q7Z5N4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SDK1Q7Z5N4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SDK1Q7Z5N4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SDK1Q7Z5N4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SDK1Q7Z5N4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SDK1Q7Z5N4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SDK1Q7Z5N4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SDK1Q7Z5N4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SDK1Q7Z5N4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SDK1Q7Z5N4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SDK1Q7Z5N4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SDK1Q7Z5N4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SDK1Q7Z5N4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SDK1Q7Z5N4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SDK1Q7Z5N4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SDK1Q7Z5N4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SDK1Q7Z5N4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SDK1Q7Z5N4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SDK1Q7Z5N4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SDK1Q7Z5N4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SDK1Q7Z5N4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SDK1Q7Z5N4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SDK1Q7Z5N4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SDK1Q7Z5N4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SDK1Q7Z5N4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SDK1Q7Z5N4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SDK1Q7Z5N4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SDK1Q7Z5N4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SDK1Q7Z5N4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SDK1Q7Z5N4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SDK1Q7Z5N4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SDK1Q7Z5N4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SDK1Q7Z5N4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SDK1Q7Z5N4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SDK1Q7Z5N4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SDK1Q7Z5N4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SDK1Q7Z5N4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SDK1Q7Z5N4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SDK1Q7Z5N4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SDK1Q7Z5N4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SDK1Q7Z5N4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SDK1Q7Z5N4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SDK1Q7Z5N4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SDK1Q7Z5N4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SDK1Q7Z5N4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SDK1Q7Z5N4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SDK1Q7Z5N4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SDK1Q7Z5N4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SDK1Q7Z5N4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SDK1Q7Z5N4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SDK1Q7Z5N4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SDK1Q7Z5N4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SDK1Q7Z5N4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SDK1Q7Z5N4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SDK1Q7Z5N4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SDK1Q7Z5N4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SDK1Q7Z5N4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SDK1Q7Z5N4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SDK1Q7Z5N4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SDK1Q7Z5N4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SDK1Q7Z5N4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SDK1Q7Z5N4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SDK1Q7Z5N4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SDK1Q7Z5N4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SDK1Q7Z5N4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SDK1Q7Z5N4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SDK1Q7Z5N4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SDK1Q7Z5N4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SDK1Q7Z5N4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SDK1Q7Z5N4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SDK1Q7Z5N4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SDK1Q7Z5N4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SDK1Q7Z5N4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SDK1Q7Z5N4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SDK1Q7Z5N4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SDK1Q7Z5N4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SDK1Q7Z5N4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SDK1Q7Z5N4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SDK1Q7Z5N4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SDK1Q7Z5N4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SDK1Q7Z5N4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms