Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3C6

ATG9A, Autophagy-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9AQ7Z3C6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
ATG9AQ7Z3C6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
ATG9AQ7Z3C6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
ATG9AQ7Z3C6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
ATG9AQ7Z3C6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
ATG9AQ7Z3C6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
ATG9AQ7Z3C6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
ATG9AQ7Z3C6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
ATG9AQ7Z3C6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
ATG9AQ7Z3C6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
ATG9AQ7Z3C6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
ATG9AQ7Z3C6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
ATG9AQ7Z3C6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
ATG9AQ7Z3C6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC31.47■■■□□ 2.63
ATG9AQ7Z3C6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC31.47■■■□□ 2.63
ATG9AQ7Z3C6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
ATG9AQ7Z3C6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
ATG9AQ7Z3C6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
ATG9AQ7Z3C6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
ATG9AQ7Z3C6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
ATG9AQ7Z3C6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
ATG9AQ7Z3C6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
ATG9AQ7Z3C6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
ATG9AQ7Z3C6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
ATG9AQ7Z3C6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
ATG9AQ7Z3C6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
ATG9AQ7Z3C6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
ATG9AQ7Z3C6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
ATG9AQ7Z3C6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
ATG9AQ7Z3C6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
ATG9AQ7Z3C6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
ATG9AQ7Z3C6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
ATG9AQ7Z3C6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
ATG9AQ7Z3C6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
ATG9AQ7Z3C6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
ATG9AQ7Z3C6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
ATG9AQ7Z3C6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
ATG9AQ7Z3C6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
ATG9AQ7Z3C6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
ATG9AQ7Z3C6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
ATG9AQ7Z3C6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
ATG9AQ7Z3C6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
ATG9AQ7Z3C6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
ATG9AQ7Z3C6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
ATG9AQ7Z3C6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
ATG9AQ7Z3C6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
ATG9AQ7Z3C6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
ATG9AQ7Z3C6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
ATG9AQ7Z3C6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
ATG9AQ7Z3C6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
ATG9AQ7Z3C6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
ATG9AQ7Z3C6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
ATG9AQ7Z3C6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
ATG9AQ7Z3C6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
ATG9AQ7Z3C6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
ATG9AQ7Z3C6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
ATG9AQ7Z3C6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
ATG9AQ7Z3C6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
ATG9AQ7Z3C6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
ATG9AQ7Z3C6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
ATG9AQ7Z3C6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
ATG9AQ7Z3C6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
ATG9AQ7Z3C6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
ATG9AQ7Z3C6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
ATG9AQ7Z3C6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
ATG9AQ7Z3C6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
ATG9AQ7Z3C6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
ATG9AQ7Z3C6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
ATG9AQ7Z3C6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
ATG9AQ7Z3C6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
ATG9AQ7Z3C6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
ATG9AQ7Z3C6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
ATG9AQ7Z3C6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
ATG9AQ7Z3C6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
ATG9AQ7Z3C6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
ATG9AQ7Z3C6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
ATG9AQ7Z3C6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
ATG9AQ7Z3C6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
ATG9AQ7Z3C6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
ATG9AQ7Z3C6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
ATG9AQ7Z3C6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
ATG9AQ7Z3C6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
ATG9AQ7Z3C6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
ATG9AQ7Z3C6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
ATG9AQ7Z3C6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
ATG9AQ7Z3C6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
ATG9AQ7Z3C6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
ATG9AQ7Z3C6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
ATG9AQ7Z3C6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
ATG9AQ7Z3C6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
ATG9AQ7Z3C6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
ATG9AQ7Z3C6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
ATG9AQ7Z3C6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
ATG9AQ7Z3C6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
ATG9AQ7Z3C6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
ATG9AQ7Z3C6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.59
ATG9AQ7Z3C6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
ATG9AQ7Z3C6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
ATG9AQ7Z3C6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
ATG9AQ7Z3C6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms