Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5L3

GDPD3, Lysophospholipase D GDPD3, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD3Q7L5L3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDPD3Q7L5L3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDPD3Q7L5L3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDPD3Q7L5L3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDPD3Q7L5L3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GDPD3Q7L5L3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GDPD3Q7L5L3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GDPD3Q7L5L3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDPD3Q7L5L3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDPD3Q7L5L3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDPD3Q7L5L3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDPD3Q7L5L3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDPD3Q7L5L3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDPD3Q7L5L3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDPD3Q7L5L3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDPD3Q7L5L3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDPD3Q7L5L3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDPD3Q7L5L3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDPD3Q7L5L3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDPD3Q7L5L3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDPD3Q7L5L3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GDPD3Q7L5L3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GDPD3Q7L5L3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GDPD3Q7L5L3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GDPD3Q7L5L3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GDPD3Q7L5L3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GDPD3Q7L5L3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GDPD3Q7L5L3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GDPD3Q7L5L3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GDPD3Q7L5L3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GDPD3Q7L5L3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GDPD3Q7L5L3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GDPD3Q7L5L3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GDPD3Q7L5L3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GDPD3Q7L5L3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GDPD3Q7L5L3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GDPD3Q7L5L3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GDPD3Q7L5L3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GDPD3Q7L5L3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GDPD3Q7L5L3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GDPD3Q7L5L3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GDPD3Q7L5L3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GDPD3Q7L5L3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GDPD3Q7L5L3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GDPD3Q7L5L3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GDPD3Q7L5L3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GDPD3Q7L5L3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GDPD3Q7L5L3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GDPD3Q7L5L3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GDPD3Q7L5L3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GDPD3Q7L5L3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GDPD3Q7L5L3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GDPD3Q7L5L3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GDPD3Q7L5L3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GDPD3Q7L5L3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GDPD3Q7L5L3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GDPD3Q7L5L3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GDPD3Q7L5L3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GDPD3Q7L5L3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GDPD3Q7L5L3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GDPD3Q7L5L3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GDPD3Q7L5L3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GDPD3Q7L5L3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GDPD3Q7L5L3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GDPD3Q7L5L3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GDPD3Q7L5L3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GDPD3Q7L5L3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GDPD3Q7L5L3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GDPD3Q7L5L3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GDPD3Q7L5L3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GDPD3Q7L5L3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GDPD3Q7L5L3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GDPD3Q7L5L3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GDPD3Q7L5L3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GDPD3Q7L5L3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GDPD3Q7L5L3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GDPD3Q7L5L3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GDPD3Q7L5L3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GDPD3Q7L5L3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GDPD3Q7L5L3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GDPD3Q7L5L3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GDPD3Q7L5L3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GDPD3Q7L5L3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GDPD3Q7L5L3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GDPD3Q7L5L3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GDPD3Q7L5L3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GDPD3Q7L5L3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDPD3Q7L5L3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDPD3Q7L5L3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDPD3Q7L5L3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDPD3Q7L5L3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDPD3Q7L5L3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDPD3Q7L5L3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDPD3Q7L5L3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDPD3Q7L5L3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDPD3Q7L5L3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDPD3Q7L5L3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDPD3Q7L5L3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDPD3Q7L5L3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDPD3Q7L5L3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms