Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVL6

KIAA1549L, UPF0606 protein KIAA1549L, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549LQ6ZVL6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
KIAA1549LQ6ZVL6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KIAA1549LQ6ZVL6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KIAA1549LQ6ZVL6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KIAA1549LQ6ZVL6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
KIAA1549LQ6ZVL6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KIAA1549LQ6ZVL6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
KIAA1549LQ6ZVL6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KIAA1549LQ6ZVL6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KIAA1549LQ6ZVL6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KIAA1549LQ6ZVL6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KIAA1549LQ6ZVL6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KIAA1549LQ6ZVL6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KIAA1549LQ6ZVL6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KIAA1549LQ6ZVL6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KIAA1549LQ6ZVL6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KIAA1549LQ6ZVL6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KIAA1549LQ6ZVL6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KIAA1549LQ6ZVL6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KIAA1549LQ6ZVL6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KIAA1549LQ6ZVL6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KIAA1549LQ6ZVL6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KIAA1549LQ6ZVL6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KIAA1549LQ6ZVL6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KIAA1549LQ6ZVL6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KIAA1549LQ6ZVL6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KIAA1549LQ6ZVL6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KIAA1549LQ6ZVL6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KIAA1549LQ6ZVL6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KIAA1549LQ6ZVL6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
KIAA1549LQ6ZVL6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KIAA1549LQ6ZVL6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KIAA1549LQ6ZVL6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
KIAA1549LQ6ZVL6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KIAA1549LQ6ZVL6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KIAA1549LQ6ZVL6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KIAA1549LQ6ZVL6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KIAA1549LQ6ZVL6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KIAA1549LQ6ZVL6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KIAA1549LQ6ZVL6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KIAA1549LQ6ZVL6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KIAA1549LQ6ZVL6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
KIAA1549LQ6ZVL6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KIAA1549LQ6ZVL6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KIAA1549LQ6ZVL6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
KIAA1549LQ6ZVL6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KIAA1549LQ6ZVL6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KIAA1549LQ6ZVL6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KIAA1549LQ6ZVL6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KIAA1549LQ6ZVL6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KIAA1549LQ6ZVL6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KIAA1549LQ6ZVL6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KIAA1549LQ6ZVL6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KIAA1549LQ6ZVL6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KIAA1549LQ6ZVL6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KIAA1549LQ6ZVL6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
KIAA1549LQ6ZVL6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
KIAA1549LQ6ZVL6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KIAA1549LQ6ZVL6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KIAA1549LQ6ZVL6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KIAA1549LQ6ZVL6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KIAA1549LQ6ZVL6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KIAA1549LQ6ZVL6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KIAA1549LQ6ZVL6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KIAA1549LQ6ZVL6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KIAA1549LQ6ZVL6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KIAA1549LQ6ZVL6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KIAA1549LQ6ZVL6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KIAA1549LQ6ZVL6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KIAA1549LQ6ZVL6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KIAA1549LQ6ZVL6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KIAA1549LQ6ZVL6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KIAA1549LQ6ZVL6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KIAA1549LQ6ZVL6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KIAA1549LQ6ZVL6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KIAA1549LQ6ZVL6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
KIAA1549LQ6ZVL6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
KIAA1549LQ6ZVL6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
KIAA1549LQ6ZVL6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
KIAA1549LQ6ZVL6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KIAA1549LQ6ZVL6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
KIAA1549LQ6ZVL6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KIAA1549LQ6ZVL6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
KIAA1549LQ6ZVL6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KIAA1549LQ6ZVL6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KIAA1549LQ6ZVL6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KIAA1549LQ6ZVL6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KIAA1549LQ6ZVL6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
KIAA1549LQ6ZVL6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KIAA1549LQ6ZVL6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KIAA1549LQ6ZVL6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KIAA1549LQ6ZVL6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KIAA1549LQ6ZVL6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KIAA1549LQ6ZVL6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KIAA1549LQ6ZVL6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
KIAA1549LQ6ZVL6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KIAA1549LQ6ZVL6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KIAA1549LQ6ZVL6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KIAA1549LQ6ZVL6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
KIAA1549LQ6ZVL6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms