Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN04

MEX3B, RNA-binding protein MEX3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEX3BQ6ZN04 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MEX3BQ6ZN04 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MEX3BQ6ZN04 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MEX3BQ6ZN04 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MEX3BQ6ZN04 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MEX3BQ6ZN04 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MEX3BQ6ZN04 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MEX3BQ6ZN04 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MEX3BQ6ZN04 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MEX3BQ6ZN04 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MEX3BQ6ZN04 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MEX3BQ6ZN04 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MEX3BQ6ZN04 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MEX3BQ6ZN04 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MEX3BQ6ZN04 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MEX3BQ6ZN04 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MEX3BQ6ZN04 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MEX3BQ6ZN04 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MEX3BQ6ZN04 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MEX3BQ6ZN04 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MEX3BQ6ZN04 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MEX3BQ6ZN04 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MEX3BQ6ZN04 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MEX3BQ6ZN04 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MEX3BQ6ZN04 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MEX3BQ6ZN04 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MEX3BQ6ZN04 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MEX3BQ6ZN04 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MEX3BQ6ZN04 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MEX3BQ6ZN04 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MEX3BQ6ZN04 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MEX3BQ6ZN04 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MEX3BQ6ZN04 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MEX3BQ6ZN04 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MEX3BQ6ZN04 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MEX3BQ6ZN04 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MEX3BQ6ZN04 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MEX3BQ6ZN04 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MEX3BQ6ZN04 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MEX3BQ6ZN04 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MEX3BQ6ZN04 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MEX3BQ6ZN04 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MEX3BQ6ZN04 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MEX3BQ6ZN04 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MEX3BQ6ZN04 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MEX3BQ6ZN04 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MEX3BQ6ZN04 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MEX3BQ6ZN04 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MEX3BQ6ZN04 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MEX3BQ6ZN04 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MEX3BQ6ZN04 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MEX3BQ6ZN04 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MEX3BQ6ZN04 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MEX3BQ6ZN04 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MEX3BQ6ZN04 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MEX3BQ6ZN04 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MEX3BQ6ZN04 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MEX3BQ6ZN04 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MEX3BQ6ZN04 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MEX3BQ6ZN04 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MEX3BQ6ZN04 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MEX3BQ6ZN04 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MEX3BQ6ZN04 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MEX3BQ6ZN04 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MEX3BQ6ZN04 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MEX3BQ6ZN04 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MEX3BQ6ZN04 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MEX3BQ6ZN04 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MEX3BQ6ZN04 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MEX3BQ6ZN04 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MEX3BQ6ZN04 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MEX3BQ6ZN04 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MEX3BQ6ZN04 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MEX3BQ6ZN04 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
MEX3BQ6ZN04 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MEX3BQ6ZN04 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MEX3BQ6ZN04 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MEX3BQ6ZN04 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MEX3BQ6ZN04 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MEX3BQ6ZN04 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MEX3BQ6ZN04 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MEX3BQ6ZN04 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MEX3BQ6ZN04 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MEX3BQ6ZN04 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MEX3BQ6ZN04 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MEX3BQ6ZN04 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MEX3BQ6ZN04 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MEX3BQ6ZN04 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MEX3BQ6ZN04 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MEX3BQ6ZN04 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MEX3BQ6ZN04 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEX3BQ6ZN04 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEX3BQ6ZN04 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEX3BQ6ZN04 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEX3BQ6ZN04 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEX3BQ6ZN04 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MEX3BQ6ZN04 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MEX3BQ6ZN04 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEX3BQ6ZN04 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEX3BQ6ZN04 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms