Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY18

LINGO4, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO4Q6UY18 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LINGO4Q6UY18 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LINGO4Q6UY18 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LINGO4Q6UY18 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LINGO4Q6UY18 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LINGO4Q6UY18 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LINGO4Q6UY18 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LINGO4Q6UY18 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LINGO4Q6UY18 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LINGO4Q6UY18 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LINGO4Q6UY18 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LINGO4Q6UY18 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LINGO4Q6UY18 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LINGO4Q6UY18 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LINGO4Q6UY18 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LINGO4Q6UY18 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LINGO4Q6UY18 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
LINGO4Q6UY18 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LINGO4Q6UY18 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LINGO4Q6UY18 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LINGO4Q6UY18 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LINGO4Q6UY18 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LINGO4Q6UY18 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LINGO4Q6UY18 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LINGO4Q6UY18 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LINGO4Q6UY18 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LINGO4Q6UY18 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LINGO4Q6UY18 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LINGO4Q6UY18 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LINGO4Q6UY18 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LINGO4Q6UY18 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LINGO4Q6UY18 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LINGO4Q6UY18 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LINGO4Q6UY18 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LINGO4Q6UY18 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LINGO4Q6UY18 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LINGO4Q6UY18 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LINGO4Q6UY18 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LINGO4Q6UY18 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LINGO4Q6UY18 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LINGO4Q6UY18 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LINGO4Q6UY18 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LINGO4Q6UY18 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LINGO4Q6UY18 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LINGO4Q6UY18 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LINGO4Q6UY18 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LINGO4Q6UY18 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LINGO4Q6UY18 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LINGO4Q6UY18 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LINGO4Q6UY18 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LINGO4Q6UY18 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LINGO4Q6UY18 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LINGO4Q6UY18 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LINGO4Q6UY18 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LINGO4Q6UY18 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LINGO4Q6UY18 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LINGO4Q6UY18 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LINGO4Q6UY18 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LINGO4Q6UY18 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LINGO4Q6UY18 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
LINGO4Q6UY18 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LINGO4Q6UY18 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LINGO4Q6UY18 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LINGO4Q6UY18 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LINGO4Q6UY18 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LINGO4Q6UY18 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LINGO4Q6UY18 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LINGO4Q6UY18 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LINGO4Q6UY18 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LINGO4Q6UY18 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LINGO4Q6UY18 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LINGO4Q6UY18 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LINGO4Q6UY18 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LINGO4Q6UY18 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LINGO4Q6UY18 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LINGO4Q6UY18 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LINGO4Q6UY18 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LINGO4Q6UY18 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LINGO4Q6UY18 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LINGO4Q6UY18 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LINGO4Q6UY18 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LINGO4Q6UY18 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LINGO4Q6UY18 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LINGO4Q6UY18 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LINGO4Q6UY18 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LINGO4Q6UY18 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LINGO4Q6UY18 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LINGO4Q6UY18 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LINGO4Q6UY18 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LINGO4Q6UY18 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LINGO4Q6UY18 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LINGO4Q6UY18 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LINGO4Q6UY18 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LINGO4Q6UY18 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LINGO4Q6UY18 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LINGO4Q6UY18 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LINGO4Q6UY18 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
LINGO4Q6UY18 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LINGO4Q6UY18 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LINGO4Q6UY18 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms