Protein–RNA interactions for Protein: Q6RSH7

VHLL, von Hippel-Lindau-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VHLLQ6RSH7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VHLLQ6RSH7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
VHLLQ6RSH7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
VHLLQ6RSH7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VHLLQ6RSH7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VHLLQ6RSH7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VHLLQ6RSH7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VHLLQ6RSH7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VHLLQ6RSH7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VHLLQ6RSH7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VHLLQ6RSH7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
VHLLQ6RSH7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VHLLQ6RSH7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VHLLQ6RSH7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VHLLQ6RSH7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VHLLQ6RSH7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VHLLQ6RSH7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VHLLQ6RSH7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
VHLLQ6RSH7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VHLLQ6RSH7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VHLLQ6RSH7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VHLLQ6RSH7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VHLLQ6RSH7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VHLLQ6RSH7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VHLLQ6RSH7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
VHLLQ6RSH7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VHLLQ6RSH7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VHLLQ6RSH7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VHLLQ6RSH7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VHLLQ6RSH7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VHLLQ6RSH7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VHLLQ6RSH7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VHLLQ6RSH7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VHLLQ6RSH7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VHLLQ6RSH7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VHLLQ6RSH7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VHLLQ6RSH7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VHLLQ6RSH7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VHLLQ6RSH7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VHLLQ6RSH7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VHLLQ6RSH7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VHLLQ6RSH7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VHLLQ6RSH7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
VHLLQ6RSH7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VHLLQ6RSH7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VHLLQ6RSH7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VHLLQ6RSH7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VHLLQ6RSH7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VHLLQ6RSH7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VHLLQ6RSH7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VHLLQ6RSH7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VHLLQ6RSH7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VHLLQ6RSH7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VHLLQ6RSH7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VHLLQ6RSH7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VHLLQ6RSH7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VHLLQ6RSH7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VHLLQ6RSH7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
VHLLQ6RSH7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VHLLQ6RSH7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VHLLQ6RSH7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VHLLQ6RSH7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VHLLQ6RSH7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VHLLQ6RSH7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VHLLQ6RSH7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VHLLQ6RSH7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VHLLQ6RSH7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VHLLQ6RSH7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VHLLQ6RSH7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VHLLQ6RSH7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VHLLQ6RSH7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VHLLQ6RSH7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
VHLLQ6RSH7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VHLLQ6RSH7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VHLLQ6RSH7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VHLLQ6RSH7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VHLLQ6RSH7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VHLLQ6RSH7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VHLLQ6RSH7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VHLLQ6RSH7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VHLLQ6RSH7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VHLLQ6RSH7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VHLLQ6RSH7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VHLLQ6RSH7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VHLLQ6RSH7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VHLLQ6RSH7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VHLLQ6RSH7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VHLLQ6RSH7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VHLLQ6RSH7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VHLLQ6RSH7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VHLLQ6RSH7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VHLLQ6RSH7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VHLLQ6RSH7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VHLLQ6RSH7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VHLLQ6RSH7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VHLLQ6RSH7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VHLLQ6RSH7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VHLLQ6RSH7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VHLLQ6RSH7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VHLLQ6RSH7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms