Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Z2

PKN3, Serine/threonine-protein kinase N3, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN3Q6P5Z2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PKN3Q6P5Z2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PKN3Q6P5Z2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PKN3Q6P5Z2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PKN3Q6P5Z2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PKN3Q6P5Z2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PKN3Q6P5Z2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PKN3Q6P5Z2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PKN3Q6P5Z2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PKN3Q6P5Z2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PKN3Q6P5Z2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PKN3Q6P5Z2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PKN3Q6P5Z2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PKN3Q6P5Z2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PKN3Q6P5Z2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PKN3Q6P5Z2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PKN3Q6P5Z2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PKN3Q6P5Z2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PKN3Q6P5Z2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PKN3Q6P5Z2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PKN3Q6P5Z2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PKN3Q6P5Z2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PKN3Q6P5Z2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PKN3Q6P5Z2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PKN3Q6P5Z2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PKN3Q6P5Z2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PKN3Q6P5Z2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PKN3Q6P5Z2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PKN3Q6P5Z2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PKN3Q6P5Z2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PKN3Q6P5Z2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PKN3Q6P5Z2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PKN3Q6P5Z2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PKN3Q6P5Z2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PKN3Q6P5Z2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PKN3Q6P5Z2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PKN3Q6P5Z2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PKN3Q6P5Z2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PKN3Q6P5Z2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PKN3Q6P5Z2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PKN3Q6P5Z2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PKN3Q6P5Z2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PKN3Q6P5Z2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PKN3Q6P5Z2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PKN3Q6P5Z2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PKN3Q6P5Z2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PKN3Q6P5Z2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PKN3Q6P5Z2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PKN3Q6P5Z2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PKN3Q6P5Z2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PKN3Q6P5Z2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PKN3Q6P5Z2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PKN3Q6P5Z2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PKN3Q6P5Z2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PKN3Q6P5Z2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PKN3Q6P5Z2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PKN3Q6P5Z2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PKN3Q6P5Z2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PKN3Q6P5Z2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PKN3Q6P5Z2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PKN3Q6P5Z2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PKN3Q6P5Z2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PKN3Q6P5Z2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PKN3Q6P5Z2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PKN3Q6P5Z2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PKN3Q6P5Z2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PKN3Q6P5Z2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PKN3Q6P5Z2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PKN3Q6P5Z2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PKN3Q6P5Z2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PKN3Q6P5Z2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PKN3Q6P5Z2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PKN3Q6P5Z2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PKN3Q6P5Z2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PKN3Q6P5Z2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PKN3Q6P5Z2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PKN3Q6P5Z2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PKN3Q6P5Z2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PKN3Q6P5Z2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PKN3Q6P5Z2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PKN3Q6P5Z2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PKN3Q6P5Z2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PKN3Q6P5Z2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PKN3Q6P5Z2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PKN3Q6P5Z2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PKN3Q6P5Z2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PKN3Q6P5Z2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PKN3Q6P5Z2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PKN3Q6P5Z2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PKN3Q6P5Z2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PKN3Q6P5Z2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PKN3Q6P5Z2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PKN3Q6P5Z2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PKN3Q6P5Z2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PKN3Q6P5Z2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PKN3Q6P5Z2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PKN3Q6P5Z2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PKN3Q6P5Z2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PKN3Q6P5Z2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PKN3Q6P5Z2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms